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Inicio Clínica e Investigación en Arteriosclerosis Proteómica cardiovascular: una nueva tecnología para resolver viejos problemas
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Editorial
Proteómica cardiovascular: una nueva tecnología para resolver viejos problemas
Cardiovascular Proteómica: a new technology to solve old problems
José Tuñóna,
Autor para correspondencia
jtunon@secardiologia.es

Autor para correspondencia.
, Óscar Lorenzob
a Servicio de Cardiología, Instituto de Investigación Sanitaria Fundación Jiménez Díaz, Universidad Autónoma de Madrid
b Laboratorio de Investigación Vascular, Instituto de Investigación Sanitaria Fundación Jiménez Díaz, Universidad Autónoma de Madrid
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Esto tiene un especial inter&#233;s si recordamos que muchos pacientes fallecen antes de llegar al hospital sin haberse podido beneficiar de los avances terap&#233;uticos de los que se dispone en este &#225;mbito&#46;</p><p id="par0010" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En las dos &#250;ltimas d&#233;cadas&#44; se han publicado numerosos trabajos tratando de encontrar biomarcadores plasm&#225;ticos que tuvieran capacidad pron&#243;stica y diagn&#243;stica en aterotrombosis&#44; entre otras patolog&#237;as&#46; A pesar de esto&#44; m&#225;s all&#225; de la troponina&#44; los biomarcadores propuestos no han encontrado aceptaci&#243;n para su uso en la pr&#225;ctica cl&#237;nica en esta entidad&#44; fundamentalmente debido a resultados discrepantes en diferentes estudios<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0005"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a>&#46; Esto ha creado cierto escepticismo en torno a este campo&#46; Sin embargo&#44; el n&#250;mero de biomarcadores testados hasta ahora es muy peque&#241;o si tenemos en cuenta que en el plasma puede haber hasta 900&#46;000 prote&#237;nas<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0010"><span class="elsevierStyleSup">2</span></a>&#46; Lo que s&#237; resulta evidente&#44; es que la tarea de testar una a una todas las prote&#237;nas plasm&#225;ticas puede ser un trabajo eterno a la par que muy costoso&#46;</p><p id="par0015" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En la metodolog&#237;a tradicional&#44; un investigador indagaba primero en la literatura en busca de alguna mol&#233;cula que por su funci&#243;n y caracter&#237;sticas pudiera tener valor como biomarcador&#44; estableciendo una hip&#243;tesis&#46; A continuaci&#243;n&#44; se deb&#237;an realizar los estudios necesarios en una poblaci&#243;n amplia para confirmar la hip&#243;tesis&#44; utilizando t&#233;cnicas como el ELISA&#46; El resultado con esta metodolog&#237;a es que&#44; si la mol&#233;cula es &#250;til como biomarcador&#44; se est&#225; tardando un promedio de diez a&#241;os desde la generaci&#243;n de la hip&#243;tesis hasta que est&#233; disponible el correspondiente kit diagn&#243;stico para usarlo en la pr&#225;ctica cl&#237;nica<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0010"><span class="elsevierStyleSup">2</span></a>&#46; Algo similar ocurre con la detecci&#243;n de nuevas dianas terap&#233;uticas y el desarrollo de nuevos f&#225;rmacos&#46;</p><p id="par0020" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En la &#250;ltima d&#233;cada han irrumpido con fuerza en Medicina Cardiovascular los estudios que utilizan tecnolog&#237;a prote&#243;mica&#46; Con esta tecnolog&#237;a no vamos a detectar prote&#237;nas previamente especificadas&#44; sino que realizamos un rastreo comparando dos muestras de tejido o fluido para encontrar cuales se expresan diferencialmente en la condici&#243;n estudiada&#46; Consta de dos fases esenciales<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0015"><span class="elsevierStyleSup">3</span></a>&#46; La primera&#44; es la separaci&#243;n de prote&#237;nas en la muestra a estudiar&#46; En la actualidad existen diferentes metodolog&#237;as para realizar este paso&#46; La t&#233;cnica cl&#225;sica es el uso de un gel bidimensional que separa las prote&#237;nas en una dimensi&#243;n de acuerdo con su carga el&#233;ctrica y en la otra&#44; seg&#250;n su peso molecular&#46; Se obtiene as&#237; un gel con m&#250;ltiples manchas&#44; cada una de las cuales corresponde a una prote&#237;na&#44; aunque varias manchas pueden corresponder a diferentes isoformas de una misma prote&#237;na&#46; La segunda etapa es la identificaci&#243;n de las prote&#237;nas mediante un espectr&#243;metro de masas&#44; comparando los datos obtenidos para cada mancha con las caracter&#237;sticas de todas las prote&#237;nas conocidas almacenadas en una base de datos&#44; estableciendo as&#237; de cual de ellas se trata&#46;</p><p id="par0025" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La comparaci&#243;n m&#225;s com&#250;n es la de tejido o fluido enfermo frente a sano&#44; aunque hay muchas otras de inter&#233;s&#44; como por ejemplo&#44; tejido o fluido de organismo enfermo que recibe un determinado tratamiento frente al de otro no tratado<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0015"><span class="elsevierStyleSup">3</span></a>&#46; As&#237;&#44; la gran diferencia con el m&#233;todo tradicional es que no precisamos revisar la literatura en busca de prote&#237;nas candidatas para construir una hip&#243;tesis previa&#46; Aqu&#237; debemos decidir &#250;nicamente qu&#233; tipos de tejido o fluido queremos comparar seg&#250;n cual sea la pregunta que queremos contestar con nuestro experimento&#46; Este tipo de trabajos suele arrojar diferencias en la expresi&#243;n de m&#250;ltiples prote&#237;nas pero&#44; evidentemente&#44; no explica sus mecanismos de actuaci&#243;n&#44; que deber&#225;n ser investigados en trabajos posteriores&#46;</p><p id="par0030" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La prote&#243;mica se puede aplicar a todos los niveles experimentales&#46; En primer lugar&#44; se puede ensayar en cultivos celulares&#46; De este modo se establecieron las alteraciones en la expresi&#243;n proteica que se producen al estimular c&#233;lulas monoc&#237;ticas con LDL oxidada<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0020"><span class="elsevierStyleSup">4</span></a>&#46; Con este mismo abordaje se ha visto que las plaquetas&#44; al ser estimuladas con trombina liberan m&#225;s de 300 prote&#237;nas&#44; de las cuales&#44; algunas no se sab&#237;a que eran producidas por estas c&#233;lulas&#44; como el precursor de quimioatractantes denominado secretogranina III<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0025"><span class="elsevierStyleSup">5</span></a>&#46;</p><p id="par0035" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Se pueden hacer tambi&#233;n estudios prote&#243;micos con tejido&#46; Aqu&#237; posiblemente el &#225;rea del c&#225;ncer nos lleve alguna ventaja&#44; ya que se public&#243; hace unos a&#241;os un estudio que mostraba que el an&#225;lisis prote&#243;mico de los espec&#237;menes de c&#225;ncer pulmonar extra&#237;dos en la cirug&#237;a era capaz de discernir qu&#233; pacientes iban a tener una mala evoluci&#243;n<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0030"><span class="elsevierStyleSup">6</span></a>&#46; Posteriormente&#44; en un estudio similar&#44; Pasterkamp y colaboradores analizaron los espec&#237;menes extra&#237;dos de endarterectom&#237;a carot&#237;dea e identificaron que una elevada presencia de osteopontina se asociaba con una mayor incidencia de eventos cardiovasculares tras la cirug&#237;a<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0035"><span class="elsevierStyleSup">7</span></a>&#46;</p><p id="par0040" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El estudio de la sangre es especialmente atractivo en la aterotrombosis por diferentes razones&#58; 1&#41; Puede proporcionarnos mucha informaci&#243;n porque intercambia mol&#233;culas y c&#233;lulas con la pared vascular y es la responsable de la formaci&#243;n de los trombos&#46; 2&#41; Es muy accesible&#44; y&#44; si detectamos en ella nuevos biomarcadores pueden ser f&#225;cilmente trasladables a la pr&#225;ctica cl&#237;nica&#46; Dentro de la sangre podemos centrarnos en el estudio de sus componentes celulares o bien del plasma y del suero&#46; Estudiando el proteoma del monocito circulante en pacientes con s&#237;ndrome coronario agudo hemos detectado modificaciones en la expresi&#243;n de hasta 17 prote&#237;nas&#44; que posteriormente se iba normalizando y a los seis meses mostraban un patr&#243;n similar al de sujetos con cardiopat&#237;a isqu&#233;mica cr&#243;nica<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0040"><span class="elsevierStyleSup">8</span></a>&#46; Tambi&#233;n comprobamos c&#243;mo el tratamiento intensivo con estatinas modificaba la expresi&#243;n de 20 prote&#237;nas tras este cuadro<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0045"><span class="elsevierStyleSup">9</span></a>&#46;</p><p id="par0045" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Sin embargo&#44; probablemente no son los elementos celulares&#44; sino el plasma y el suero los que pueden tener m&#225;s inter&#233;s de cara a la b&#250;squeda de biomarcadores&#46; La raz&#243;n es que para investigar c&#233;lulas circulantes debemos hacer la extracci&#243;n de las c&#233;lulas en un per&#237;odo no superior a unas cuatro horas tras obtener la sangre&#44; y por m&#233;todos m&#225;s complejos que el simple centrifugado&#46; En cambio&#44; para realizar la determinaci&#243;n de la mayor parte de biomarcadores en plasma o suero basta con separarlos de las c&#233;lulas con un centrifugado de la sangre y despu&#233;s se pueden guardar congelados para su uso posterior&#46; Este tipo de procedimientos son m&#225;s f&#225;ciles de estandarizar en la pr&#225;ctica cl&#237;nica&#46;</p><p id="par0050" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En el presente n&#250;mero de Cl&#237;nica e Investigaci&#243;n en Arteriosclerosis&#44; Cubedo et al publican la comparaci&#243;n del proteoma s&#233;rico en una poblaci&#243;n de pacientes con Infarto Agudo de Miocardio &#40;IAM&#41; con elevaci&#243;n de segmento ST con un grupo de sujetos sanos<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0050"><span class="elsevierStyleSup">10</span></a>&#46; A pesar del gran rendimiento que puede llegar a dar&#44; el estudio del suero o el plasma mediante t&#233;cnicas prote&#243;micas tiene una gran complejidad&#44; pues el 90&#37; de la masa ocupada por las prote&#237;nas est&#225; constituido por solo 9 de ellas<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0015"><span class="elsevierStyleSup">3</span></a>&#46; As&#237;&#44; un paso clave antes de realizar el estudio es efectuar una separaci&#243;n de estas prote&#237;nas m&#225;s abundantes para que no tapen a otras de menor peso molecular&#46; De este modo&#44; mostraban que con suero no tratado tan solo eran visibles la alb&#250;mina&#44; la transferrina&#44; y las cadenas pesadas y ligeras de la IgG&#46; Cuando retiraban la alb&#250;mina y las IgG&#44; quedaban la alfa1-antitripsina&#44; haptoglobina y transferrina como las m&#225;s abundantes&#46; Finalmente&#44; cuando separaban tambi&#233;n &#233;stas&#44; aparec&#237;an hasta 90 prote&#237;nas no identificadas con el primer m&#233;todo&#46; En total hab&#237;a nada menos que 131 prote&#237;nas solo en el grupo de pacientes y 27 que solo estaban en el de controles&#46; Si comparamos estos resultados con trabajos previos&#44; vemos que el n&#250;mero de prote&#237;nas detectadas es mucho mayor<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0055"><span class="elsevierStyleSup">11</span></a> y este es el resultado de las mejoras t&#233;cnicas introducidas en la depleci&#243;n de las prote&#237;nas m&#225;s abundantes&#46;</p><p id="par0055" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El siguiente paso es ver el significado de la prote&#237;nas que mostraban expresi&#243;n alterada&#46; Entre los grupos funcionales de prote&#237;nas descrito por Cubedo et al aparecen algunos de los m&#225;s conocidos en la fisiopatolog&#237;a de la enfermedad coronaria&#44; como las pertenecientes al sistema inmune&#44; la coagulaci&#243;n&#44; las mol&#233;culas de adhesi&#243;n y el metabolismo lip&#237;dico&#44; y se aprecian otros a los que se conoce una menor relaci&#243;n&#46; En general&#44; en este tipo de estudios vamos a encontrar un grupo de prote&#237;nas cuyo papel en la patolog&#237;a que estamos investigando ya ser&#225; conocido&#46; Otro grupo estar&#225; constituido por prote&#237;nas ya conocidas pero no relacionadas hasta ahora con esa patolog&#237;a&#44; y en teor&#237;a ser&#225; el de m&#225;ximo inter&#233;s&#46; Finalmente&#44; puede haber un tercer grupo que ser&#237;a el formado por prote&#237;nas desconocidas hasta ahora cuyas caracter&#237;sticas no coinciden con las almacenadas en las bases de datos existentes y que requerir&#225;n m&#225;s estudios para caracterizarlas&#46;</p><p id="par0060" class="elsevierStylePara elsevierViewall">&#191;Va a conseguir la prote&#243;mica detectar los nuevos biomarcadores y dianas terap&#233;uticas que precisemos en Medicina Cardiovascular&#63; En principio podr&#237;a ser as&#237;&#44; pero este camino no est&#225; exento de dificultades&#46; En primer lugar&#44; este tipo de estudios no demuestran que las prote&#237;nas con expresi&#243;n alterada jueguen un papel en el proceso patol&#243;gico que estamos investigando y conocer este dato es especialmente importante cuando buscamos nuevas dianas sobre las que desarrollar futuros f&#225;rmacos&#46; Por consiguiente&#44; la publicaci&#243;n de listados de prote&#237;nas obtenidos en trabajos similares al realizado por Cubedo et al supone simplemente una base de partida en la b&#250;squeda de prote&#237;nas que jueguen un papel en el cuadro cl&#237;nico del IAM&#46; Posteriormente&#44; habr&#225; que seleccionar algunas prote&#237;nas cuyas funciones sugieran que pueden tener un papel relevante en el proceso para realizar estudios mecan&#237;sticos&#44; principalmente in vitro y en modelos animales&#44; para conocer su papel en la fisiopatolog&#237;a de este proceso&#46; Otro tipo de estudios ser&#237;an aquellos a realizar en seres humanos para tratar de evidenciar si las prote&#237;nas propuestas tienen capacidad de actuar como biomarcadores pron&#243;sticos o diagn&#243;sticos&#46;</p><p id="par0065" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En segundo lugar&#44; un punto de inter&#233;s es el tratamiento estad&#237;stico de los datos&#46; Dado que con esta metodolog&#237;a se identifican cientos de prote&#237;nas&#44; en general estaremos comparando los niveles de todas esas prote&#237;nas en dos tipos de muestras&#46; Esto quiere decir que estaremos haciendo cientos de tests estad&#237;sticos y que si usamos una p<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>&#60;<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>0&#44;05 en cada uno de ellos vamos a obtener diferencias en la expresi&#243;n de varias prote&#237;nas que no son reales&#46; Por tanto&#44; en prote&#243;mica se debe seleccionar muy cuidadosamente el nivel de significaci&#243;n exigido para dar como v&#225;lida la diferencia de expresi&#243;n entre las prote&#237;nas que estamos investigando&#46;</p><p id="par0070" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Por &#250;ltimo&#44; a pesar de la mejora tecnol&#243;gica que ha supuesto la incorporaci&#243;n de plataformas m&#225;s potentes y r&#225;pidas en la separaci&#243;n de prote&#237;nas&#44; como por ejemplo la denominada &#8220;shotgun proteomics&#8221;&#44; el nivel de resoluci&#243;n de esta tecnolog&#237;a dista mucho de ser el adecuado&#46; As&#237;&#44; recientemente se ha visto que combinando los resultados de tres plataformas de prote&#243;mica diferentes se llegaban a identificar 3&#46;020 prote&#237;nas&#44; un n&#250;mero a&#250;n distante de las 900&#46;000 que algunos autores sostienen que est&#225;n presentes en plasma<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0010"><span class="elsevierStyleSup">2</span></a>&#46;</p><p id="par0075" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En conclusi&#243;n&#44; los abordajes prote&#243;micos nos van a permitir sin duda dar un gran salto cuantitativo a la hora de buscar nuevas dianas terap&#233;uticas y biomarcadores&#46; Sin embargo&#44; la necesidad de complementar los hallazgos obtenidos con estudios mecan&#237;sticos&#44; las precauciones que se deben tomar en el an&#225;lisis estad&#237;stico y la limitada resoluci&#243;n de esta tecnolog&#237;a que se pone de manifiesto en fluidos tan complejos como el plasma&#44; 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Información del artículo
ISSN: 02149168
Idioma original: Español
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