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XXXV Congreso de la Sociedad Española de Diabetes GENÉTICA E INMUNOLOGÍA
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XXXV Congreso de la Sociedad Española de Diabetes
Granada, 9 - 12 abril 2024
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12. GENÉTICA E INMUNOLOGÍA
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P-013 - PERFIL DE MIRNAS SÉRICOS DIFERENCIALMENTE EXPRESADOS EN FUNCIÓN DE LA PRESENCIA DE DIABETES Y LA EXPOSICIÓN A CONTAMINACIÓN ATMOSFÉRICA. ESTUDIO DI@BET.ES

W. Oualla Bachiria,b,c,d, E. García Escobara,d, A.M. Lago-Sampedroa,b,c,d, S. Valdésa,b,d, C. Maldonado-Araquea,b,d, V. Doulatram-Gamgarama,b y G. Rojo-Martíneza,b,d

aUGC Endocrinología y Nutrición, Hospital Regional Universitario de Málaga, Málaga, España. bInstituto de Investigación Biomédica de Málaga, Plataforma Bionand, Málaga, España. cUniversidad de Málaga, Málaga, España. dCIBER de Diabetes y Enfermedades Metabólicas Asociadas, Instituto de Salud Carlos III, Madrid, España.

Introducción: Los microRNAs son pequeñas moléculas de RNA no codificante que regulan a nivel postranscripcional el RNA mensajero. Hay evidencias de que la contaminación altera el perfil de expresión de miRNAs en el epitelio pulmonar y esto podría ser uno de los mecanismos epigenéticos relacionados con el desarrollo de procesos patológicos metabólicos.

Objetivos: Determinar miRNAs séricos diferencialmente expresados en sujetos con diabetes y/o expuestos a contaminantes PM10 y el efecto que tienen estos miRNAs sobre genes clave de rutas metabólicas asociadas a la diabetes.

Metodología: Los miRNAs se extrajeron del suero de sujetos del estudio Di@bet.es con grado de exposición a PM10 por encima del percentil 95 (exposición alta, n = 24: 12 con diabetes) y por debajo del percentil 5 (exposición baja, n = 24; 12 con diabetes). Los sujetos fueron pareados por edad, sexo, IMC y glucemia. La extracción de los miRNAs se realizó con el kit miRNeasy. Los niveles de miRNAs séricos se determinaron mediante small RNAseq en Ion Torrent®. La preparación de las librerías se realizó con el kit QIAseq® miRNA Library. El templado y la carga del chip con el kit Ion 540™ Kit-Chef e Ion 540™ Chip. Tras la secuenciación, el análisis bioinformático y estadístico de la expresión diferencial se realizó con el software de GeneGlobe Data Analysis de QIAgen acorde a lo indicado por el fabricante. El análisis de enriquecimiento funcional se realizó con la herramienta bioinformática DAVID.

Resultados: Se han encontrado 43 miRNAs diferencialmente expresados en sujetos con exposición alta a PM10 vs. baja controlado por diabetes (FDR < 0,05) de los cuales, se han seleccionado 7 miRNAs (FDR < 0,0001) como candidatos a estudio de validación en población completa y estudio funcional in vitro (tabla). También se han encontrado 2 miRNAs diferencialmente expresados en sujetos con diabetes vs. sin diabetes, controlando por contaminación PM10 (FDR < 0,05). En el estudio de enriquecimiento funcional de los genes diana de estos 9 miRNAs (downregulated), se ha visto que se podrían estar implicados en enfermedades como el cáncer de pulmón, EPOC y diabetes mellitus tipo 2. Además están involucrados en rutas del sistema inmune, señalización de insulina y metabolismo de carbohidratos.

miRNAs diferencialmente expresados candidatos a validación según las condiciones de estudio.

miRNA

Fold change

Fp-value

Exposición a PM10 alta vs. baja, controlado por diabetes

 hsa-miR-96-5p

-4,558

5,936-6

 hsa-miR-25-3p

-2,503

1,672-5

 hsa-miR-941

-2,979

1,955-5

 hsa-miR-106b-3p

-3,514

1,955-5

 hsa-miR-191-5p

-2,122

2,976-5

 hsa-miR-532-5p

-2,991

3,114-5

 hsa-miR-140-3p

-2,707

6,635-5

Diabetes vs. no diabetes, controlado por contaminación PM10

 hsa-miR-184

-8,680

1,217-2

 hsa-miR-144-3p

-1,894

4,936-2

Conclusiones: La exposición a niveles altos de contaminación y la presencia de diabetes tienen impacto en el perfil de expresión sérico de miRNAs que podría ser uno de los mecanismos subyacentes implicados en el desarrollo de enfermedades pulmonares y metabólicas.

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