P-013 - PERFIL DE MIRNAS SÉRICOS DIFERENCIALMENTE EXPRESADOS EN FUNCIÓN DE LA PRESENCIA DE DIABETES Y LA EXPOSICIÓN A CONTAMINACIÓN ATMOSFÉRICA. ESTUDIO DI@BET.ES
aUGC Endocrinología y Nutrición, Hospital Regional Universitario de Málaga, Málaga, España. bInstituto de Investigación Biomédica de Málaga, Plataforma Bionand, Málaga, España. cUniversidad de Málaga, Málaga, España. dCIBER de Diabetes y Enfermedades Metabólicas Asociadas, Instituto de Salud Carlos III, Madrid, España.
Introducción: Los microRNAs son pequeñas moléculas de RNA no codificante que regulan a nivel postranscripcional el RNA mensajero. Hay evidencias de que la contaminación altera el perfil de expresión de miRNAs en el epitelio pulmonar y esto podría ser uno de los mecanismos epigenéticos relacionados con el desarrollo de procesos patológicos metabólicos.
Objetivos: Determinar miRNAs séricos diferencialmente expresados en sujetos con diabetes y/o expuestos a contaminantes PM10 y el efecto que tienen estos miRNAs sobre genes clave de rutas metabólicas asociadas a la diabetes.
Metodología: Los miRNAs se extrajeron del suero de sujetos del estudio Di@bet.es con grado de exposición a PM10 por encima del percentil 95 (exposición alta, n = 24: 12 con diabetes) y por debajo del percentil 5 (exposición baja, n = 24; 12 con diabetes). Los sujetos fueron pareados por edad, sexo, IMC y glucemia. La extracción de los miRNAs se realizó con el kit miRNeasy. Los niveles de miRNAs séricos se determinaron mediante small RNAseq en Ion Torrent®. La preparación de las librerías se realizó con el kit QIAseq® miRNA Library. El templado y la carga del chip con el kit Ion 540™ Kit-Chef e Ion 540™ Chip. Tras la secuenciación, el análisis bioinformático y estadístico de la expresión diferencial se realizó con el software de GeneGlobe Data Analysis de QIAgen acorde a lo indicado por el fabricante. El análisis de enriquecimiento funcional se realizó con la herramienta bioinformática DAVID.
Resultados: Se han encontrado 43 miRNAs diferencialmente expresados en sujetos con exposición alta a PM10 vs. baja controlado por diabetes (FDR < 0,05) de los cuales, se han seleccionado 7 miRNAs (FDR < 0,0001) como candidatos a estudio de validación en población completa y estudio funcional in vitro (tabla). También se han encontrado 2 miRNAs diferencialmente expresados en sujetos con diabetes vs. sin diabetes, controlando por contaminación PM10 (FDR < 0,05). En el estudio de enriquecimiento funcional de los genes diana de estos 9 miRNAs (downregulated), se ha visto que se podrían estar implicados en enfermedades como el cáncer de pulmón, EPOC y diabetes mellitus tipo 2. Además están involucrados en rutas del sistema inmune, señalización de insulina y metabolismo de carbohidratos.
miRNAs diferencialmente expresados candidatos a validación según las condiciones de estudio. |
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miRNA |
Fold change |
Fp-value |
Exposición a PM10 alta vs. baja, controlado por diabetes |
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hsa-miR-96-5p |
-4,558 |
5,936-6 |
hsa-miR-25-3p |
-2,503 |
1,672-5 |
hsa-miR-941 |
-2,979 |
1,955-5 |
hsa-miR-106b-3p |
-3,514 |
1,955-5 |
hsa-miR-191-5p |
-2,122 |
2,976-5 |
hsa-miR-532-5p |
-2,991 |
3,114-5 |
hsa-miR-140-3p |
-2,707 |
6,635-5 |
Diabetes vs. no diabetes, controlado por contaminación PM10 |
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hsa-miR-184 |
-8,680 |
1,217-2 |
hsa-miR-144-3p |
-1,894 |
4,936-2 |
Conclusiones: La exposición a niveles altos de contaminación y la presencia de diabetes tienen impacto en el perfil de expresión sérico de miRNAs que podría ser uno de los mecanismos subyacentes implicados en el desarrollo de enfermedades pulmonares y metabólicas.