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class="elsevierStyleItalic">chip</span> AMR Direct Flow Chip®. A) Plataforma automatizada HS24 para el procesamiento de la hibridación reversa y análisis de la imagen. B) Resultados para una cepa de <span class="elsevierStyleItalic">Escherichia coli</span> productora de carbapenemasas. C) Detección de microorganismos MDR en un hisopo rectal positivo que albergaba <span class="elsevierStyleItalic">Klebsiella pneumoniae</span><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-48</span>/<span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">SHV</span> y <span class="elsevierStyleItalic">Acinetobacter baumannii</span><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-51</span>. Todas las sondas se disponen por duplicado en la matriz del <span class="elsevierStyleItalic">chip</span> y un resultado se considera positivo si se detectan ambas señales. Sondas positivas detectadas: control de biotina (BC); control exógeno de amplificación (IC), para la detección de ADN sintético incluido en el <span class="elsevierStyleItalic">mix</span> de la PCR; control endógeno de amplificación (BG), para la detección del gen <span class="elsevierStyleItalic">beta-globina</span> humano; <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">VIM</span> (VIM); <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">SHV</span> (SHV); <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-48</span> (OXA48) y <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-51</span> (OXA51). La imagen está ampliada ×5 en comparación con el tamaño real del <span class="elsevierStyleItalic">chip</span>.</p>" ] ] ] "textoCompleto" => "<span class="elsevierStyleSections"><span id="sec0005" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0065">Introducción</span><p id="par0005" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La resistencia antimicrobiana es una amenaza para la salud pública mundial<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0055"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a>, ya que supone un aumento en la morbimortalidad<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0060"><span class="elsevierStyleSup">2</span></a>. Aunque el desarrollo de resistencias es un fenómeno biológico natural, el uso de antibióticos ha contribuido al incremento de estas<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0065"><span class="elsevierStyleSup">3</span></a>.</p><p id="par0010" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El tiempo habitual para obtener la sensibilidad a antimicrobianos de un microorganismo varía entre 24 y 72<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>h, tiempo que se puede reducir mediante la utilización de pruebas rápidas de diagnóstico.</p><p id="par0015" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Existen diversas pruebas moleculares para el cribado de pacientes colonizados por microorganismos resistentes, como el Xpert® MRSA, el Xpert® vanA/vanB o el Xpert® Carba-R (Cepheid Inc., Sunnyvale, CA, EE. UU.), si bien todavía poseen algunas limitaciones en cuanto al número de dianas detectadas en un ensayo simple<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0070"><span class="elsevierStyleSup">4,5</span></a>.</p><p id="par0020" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El kit Antimicrobial Resistance Direct Flow Chip® (Master Diagnóstica, Granada, España) (AMR) es un sistema de diagnóstico molecular basado en una PCR multiplex seguida de hibridación reversa tipo <span class="elsevierStyleItalic">dot blot</span> en <span class="elsevierStyleItalic">arrays</span> de ADN, completamente automatizada mediante la plataforma HS24. Este sistema permite detectar 20 familias de genes de resistencia en bacterias grampositivas y gramnegativas (genes <span class="elsevierStyleItalic">mecA</span>, <span class="elsevierStyleItalic">vanA/B</span> y genes de betalactamasas de espectro extendido [BLEE], de carbapenemasas de clase A, B y D, así como la especie <span class="elsevierStyleItalic">Staphylococcus aureus</span>) (<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#tbl0005">tabla 1</a>)<span class="elsevierStyleItalic">.</span> El ensayo se puede realizar directamente sobre hisopos nasales o rectales, colonias bacterianas o hemocultivos, con un tiempo de obtención de resultados de aproximadamente 3<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>h.</p><elsevierMultimedia ident="tbl0005"></elsevierMultimedia><p id="par0025" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El objetivo fue realizar una evaluación clínica de este kit AMR para la detección de pacientes críticos colonizados por <span class="elsevierStyleItalic">S. aureus</span> resistente a la meticilina (SARM) en hisopos nasales, por <span class="elsevierStyleItalic">Enterococcus</span> spp. resistentes a vancomicina (ERV), BLEE o productores de carbapenemasas en hisopos rectales.</p></span><span id="sec0010" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0070">Material y métodos</span><span id="sec0015" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0075">Muestras</span><p id="par0030" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Para la evaluación preclínica del kit AMR se emplearon 104 cepas bien caracterizadas de nuestra colección procedentes de muestras clínicas (<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#sec0065">Tabla S1</a>). Las cepas se caracterizaron mediante el Xpert® MRSA y Xpert® VanA/VanB (aislados grampositivos) y mediante un ensayo TaqMan® multiplex PCR en aislados gramnegativos y posterior secuenciación<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0080"><span class="elsevierStyleSup">6,7</span></a>.</p><p id="par0035" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Para la evaluación clínica se emplearon 210 muestras (90 nasales y 120 rectales) recogidas secuencialmente de pacientes ingresados en la UCI en 2 periodos independientes de 4 meses cada uno. Las muestras se recogieron con hisopos con medio de transporte (Copan Diagnostics Inc., Murrieta, CA, EE. UU.) y se analizaron en paralelo empleando métodos microbiológicos convencionales y el kit AMR, para el que se utilizó el excedente de la muestra una vez utilizada para el diagnóstico convencional. Los datos se analizaron de forma anonimizada.</p></span><span id="sec0020" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0080">Cribado mediante métodos convencionales</span><p id="par0040" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Los 90 hisopos nasales para la detección de SARM se cultivaron en medio ChromID® MRSA agar (bioMérieux, Marcy-l’Etoile, Francia) a 37<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>°<span class="elsevierStyleSmallCaps">C</span> durante 24<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>h, identificando los microorganismos mediante MALDI-TOF. En el caso de <span class="elsevierStyleItalic">S. aureus</span> se realizó una confirmación adicional mediante Xpert® MRSA para la detección de la resistencia a meticilina.</p><p id="par0045" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Para el cribado de ERV, cepas productoras de BLEE y de carbapenemasas, las muestras se cultivaron en placas ChromID® VRE, ESBL y Carba Smart (bioMérieux, Marcy-l’Etoile, Francia), respectivamente, con incubación a 37<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>°C, 24<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>h. Los microorganismos crecidos se identificaron mediante MALDI-TOF. La detección de los genes <span class="elsevierStyleItalic">vanA/B</span> se realizó mediante el sistema Xpert® vanA/vanB, y la de los genes codificantes de BLEE, carbapenemasas y AmpC, mediante métodos previamente publicados<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0090"><span class="elsevierStyleSup">8</span></a>.</p></span><span id="sec0025" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0085">Ensayo con el kit AMR Direct Flow Chip®</span><p id="par0050" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Para la validación preclínica, las cepas se sembraron en medio agar-sangre (5% Columbia Blood Agar; bioMérieux, Marcy-l’Etoile, Francia) y se incubaron a 37<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>°C, 18-24<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>h. Tras resuspender una única colonia en 100<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>μl de agua destilada estéril, se cogieron 5<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>μl de esa muestra y se llevaron hasta 50<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>μl con los reactivos de amplificación del kit (43,5<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>μl de solución tampón y 1,5<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>μl de la enzima PCR).</p><p id="par0055" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Para la validación clínica, los hisopos nasales y rectales se resuspendieron en 0,5<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>ml de agua estéril y se mezclaron mediante agitación. Para la PCR se emplearon 5<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>μl de la suspensión de los hisopos nasales y 5<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>μl de una dilución (1/10) de la suspensión de los hisopos rectales. La PCR se realizó del modo descrito anteriormente (termociclador GeneAmp® PCR System 9600; Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, EE. UU.), como sigue: 10<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>min a 25<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>°C; 3<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>min a 95<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>°C; 40 ciclos a 95<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>°C durante 15<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>s, seguidos de 45<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>s a 50<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>°C, un minuto a 72<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>°C y almacenamiento a 4<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>°C. El tiempo total fue de 2<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>h.</p><p id="par0060" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Tras la realización de la PCR se empleó la plataforma automatizada hybriSpot HS24 (Master Diagnóstica, Granada, España) (<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#fig0005">fig. 1</a>A), que realiza una hibridación reversa tipo <span class="elsevierStyleItalic">dot blot</span> de hasta 24 muestras simultáneamente e interpreta los resultados en una hora. Cuando los amplicones específicos hibridan con sus correspondientes sondas, las señales se visualizan a través de una reacción colorimétrica (<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#fig0005">fig. 1</a>B y C). La plataforma hybriSpot HS24 captura la imagen del <span class="elsevierStyleItalic">chip,</span> que es analizada automáticamente mediante un patrón de puntos que corresponde a un perfil de determinantes genéticos de resistencia (<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#fig0005">fig. 1</a>).</p><elsevierMultimedia ident="fig0005"></elsevierMultimedia></span><span id="sec0030" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0090">Análisis estadístico</span><p id="par0065" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Se calcularon las tablas de contingencia teniendo en cuenta los resultados obtenidos por técnicas convencionales <span class="elsevierStyleItalic">(gold standard)</span> y mediante el AMR. La sensibilidad, la especificidad y los intervalos de confianza del 95% se calcularon empleando el <span class="elsevierStyleItalic">software</span> SPSS v17.0.</p></span></span><span id="sec0035" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0095">Resultados y discusión</span><span id="sec0040" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0100">Resultados de la validación preclínica</span><p id="par0070" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Los resultados obtenidos en la validación preclínica con el AMR obtuvieron un 100% de concordancia con los resultados esperados para la colección de cepas empleadas (ver material suplementario, <a class="elsevierStyleCrossRef" href="#sec0065">Tabla S1</a>).</p></span><span id="sec0045" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0105">Resultados de la validación clínica</span><p id="par0075" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Tras el análisis de 90 hisopos nasales en paralelo para la detección de SARM, el método convencional detectó 8 muestras positivas y 82 negativas, mientras que el kit AMR detectó 10 muestras positivas (positivo gen <span class="elsevierStyleItalic">mecA</span>) y 80 negativas, con 2 falsos positivos. La sensibilidad y la especificidad en muestras clínicas fueron del 100 y el 97%, respectivamente (<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#tbl0010">tabla 2</a>).</p><elsevierMultimedia ident="tbl0010"></elsevierMultimedia><p id="par0080" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En cuanto a los hisopos rectales, empleando los métodos convencionales se detectaron 30 muestras positivas para la producción de betalactamasas, de las cuales 24 fueron clasificadas como BLEE y 6 como productoras <span class="elsevierStyleItalic">ampC</span>. Los resultados obtenidos con el AMR se muestran en la <a class="elsevierStyleCrossRef" href="#tbl0010">tabla 2</a>. Entre las 24 muestras en las que se detectaron BLEE, el kit AMR detectó simultáneamente hisopos que contenían microorganismos con más de un marcador genético de resistencia, una muestra con una cepa de <span class="elsevierStyleItalic">Acinetobacter baumannii</span> con los genes <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">CTX</span>/<span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-51</span> y 5 muestras con <span class="elsevierStyleItalic">Klebsiella pneumoniae</span>, productora de BLEE y carbapenemasas (<span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">CTX</span>/<span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">SHV</span>/<span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">VIM</span>). En 6 muestras se detectó la presencia de genes <span class="elsevierStyleItalic">ampC</span>, encontrando en 3 de ellas <span class="elsevierStyleItalic">Escherichia coli</span> con <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">CIT</span>, una con <span class="elsevierStyleItalic">A. baumannii</span> con <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">MOX</span> y 2 con <span class="elsevierStyleItalic">Enterobacter cloacae</span> con el gen cromosómico <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">EBC.</span> Para la detección de cepas productoras de carbapenemasas, el método convencional señaló 9 muestras positivas, donde los microorganismos portadores de estos marcadores genéticos de resistencia fueron <span class="elsevierStyleItalic">K. pneumoniae</span>, <span class="elsevierStyleItalic">E. coli</span> y <span class="elsevierStyleItalic">A. baumannii</span>. En cuanto a la detección de ERV, el kit AMR mostró una concordancia absoluta con los resultados obtenidos mediante los métodos convencionales. Cinco de las 6 muestras positivas contenían <span class="elsevierStyleItalic">Enterococcus faecium</span> y la restante, <span class="elsevierStyleItalic">Enterococcus faecalis</span> con los genes <span class="elsevierStyleItalic">vanA</span> o <span class="elsevierStyleItalic">vanB.</span> Estos resultados se muestran en la <a class="elsevierStyleCrossRef" href="#tbl0010">tabla 2</a>. La sensibilidad y la especificidad del kit fueron del 100% en hisopos rectales.</p><p id="par0085" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Las principales ventajas de este test fueron el tiempo para obtener el resultado (3<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>h) y la variedad de determinantes genéticos de resistencia que detecta. Sin embargo, se obtuvieron 2 falsos positivos para SARM en hisopos nasales. Esta limitación se podría explicar por la tecnología empleada en el kit, ya que detecta de forma independiente la presencia de genes de <span class="elsevierStyleItalic">S. aureus</span> y el gen <span class="elsevierStyleItalic">mecA</span>. En el caso de gramnegativos, la limitación fue la no identificación de microorganismos portadores de <span class="elsevierStyleItalic">ampC</span>, lo que puede ser un problema de cara a implementar políticas de control de infecciones.</p><p id="par0090" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Según los resultados de este estudio preliminar, el kit AMR es un ensayo versátil para el cribado de pacientes portadores de microorganismos multirresistentes directamente a partir de muestras clínicas, ya sea mediante hisopos nasales o rectales, reproduciendo resultados similares a los obtenidos por otras pruebas de diagnóstico, como el Xpert® MRSA<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0095"><span class="elsevierStyleSup">9</span></a> o el Xpert® Carba-R<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0100"><span class="elsevierStyleSup">10</span></a>.</p><p id="par0095" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El método detecta, empleando un ensayo sencillo y directo, 21 dianas, incluyendo SARM, ERV, BLEE y carbapenemasas, por lo que puede ser una herramienta útil en los programas de vigilancia de resistencia. No obstante, se deberán realizar otros estudios adicionales para analizar el impacto clínico a largo plazo de esta nueva herramienta de diagnóstico.</p></span></span><span id="sec0050" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0110">Financiación</span><p id="par0100" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Esta investigación ha sido financiada por la Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana (FISABIO) con referencia UGP-14-216.</p></span><span id="sec0055" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0115">Conflicto de intereses</span><p id="par0105" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Para la realización de este trabajo la empresa Master Diagnóstica ha cedido al equipo investigador los kits de diagnóstico AMR Direct Flow Chip®.</p></span></span>" "textoCompletoSecciones" => array:1 [ "secciones" => array:11 [ 0 => array:3 [ "identificador" => "xres1784659" "titulo" => "Resumen" "secciones" => array:4 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "abst0005" "titulo" => "Introducción" ] 1 => array:2 [ "identificador" => "abst0010" "titulo" => "Métodos" ] 2 => array:2 [ "identificador" => "abst0015" "titulo" => "Resultados" ] 3 => array:2 [ "identificador" => "abst0020" "titulo" => "Conclusiones" ] ] ] 1 => array:2 [ "identificador" => "xpalclavsec1565641" "titulo" => "Palabras clave" ] 2 => array:3 [ "identificador" => "xres1784660" "titulo" => "Abstract" "secciones" => array:4 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "abst0025" "titulo" => "Introduction" ] 1 => array:2 [ "identificador" => "abst0030" "titulo" => "Methods" ] 2 => array:2 [ "identificador" => "abst0035" "titulo" => "Results" ] 3 => array:2 [ "identificador" => "abst0040" "titulo" => "Conclusions" ] ] ] 3 => array:2 [ "identificador" => "xpalclavsec1565642" "titulo" => "Keywords" ] 4 => array:2 [ "identificador" => "sec0005" "titulo" => "Introducción" ] 5 => array:3 [ "identificador" => "sec0010" "titulo" => "Material y métodos" "secciones" => array:4 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "sec0015" "titulo" => "Muestras" ] 1 => array:2 [ "identificador" => "sec0020" "titulo" => "Cribado mediante métodos convencionales" ] 2 => array:2 [ "identificador" => "sec0025" "titulo" => "Ensayo con el kit AMR Direct Flow Chip®" ] 3 => array:2 [ "identificador" => "sec0030" "titulo" => "Análisis estadístico" ] ] ] 6 => array:3 [ "identificador" => "sec0035" "titulo" => "Resultados y discusión" "secciones" => array:2 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "sec0040" "titulo" => "Resultados de la validación preclínica" ] 1 => array:2 [ "identificador" => "sec0045" "titulo" => "Resultados de la validación clínica" ] ] ] 7 => array:2 [ "identificador" => "sec0050" "titulo" => "Financiación" ] 8 => array:2 [ "identificador" => "sec0055" "titulo" => "Conflicto de intereses" ] 9 => array:2 [ "identificador" => "xack630574" "titulo" => "Agradecimientos" ] 10 => array:1 [ "titulo" => "Bibliografía" ] ] ] "pdfFichero" => "main.pdf" "tienePdf" => true "fechaRecibido" => "2020-07-17" "fechaAceptado" => "2020-12-06" "PalabrasClave" => array:2 [ "es" => array:1 [ 0 => array:4 [ "clase" => "keyword" "titulo" => "Palabras clave" "identificador" => "xpalclavsec1565641" "palabras" => array:4 [ 0 => "Técnicas de diagnóstico molecular" 1 => "Multirresistencia a fármacos en español" 2 => "Análisis de microarrays" 3 => "Epidemiología molecular" ] ] ] "en" => array:1 [ 0 => array:4 [ "clase" => "keyword" "titulo" => "Keywords" "identificador" => "xpalclavsec1565642" "palabras" => array:4 [ 0 => "Molecular diagnostic techniques" 1 => "Multiple drug resistance en inglés" 2 => "Microarray analysis" 3 => "Molecular epidemiology" ] ] ] ] "tieneResumen" => true "resumen" => array:2 [ "es" => array:3 [ "titulo" => "Resumen" "resumen" => "<span id="abst0005" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0010">Introducción</span><p id="spar0005" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">El objetivo fue realizar la validación clínica del sistema molecular AMR Direct Flow Chip® para la detección de genes de resistencia a antimicrobianos partiendo de aislados bacterianos en cultivo, así como de hisopos de muestras nasales o rectales.</p></span> <span id="abst0010" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0015">Métodos</span><p id="spar0010" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">El ensayo AMR es una PCR multiplex seguida de hibridación reversa tipo <span class="elsevierStyleItalic">dot blot</span> en <span class="elsevierStyleItalic">arrays</span> de ADN completamente automatizada mediante la plataforma HS24, con un tiempo de realización de 3<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>h. Se realizó la validación preclínica con 104 cepas bacterianas caracterizadas y posteriormente se analizaron 210 muestras de hisopos nasales o rectales.</p></span> <span id="abst0015" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0020">Resultados</span><p id="spar0015" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">La sensibilidad y la especificidad del ensayo preclínico fueron del 100%, identificando correctamente las 104 cepas. En la validación clínica, la sensibilidad fue del 100% y la especificidad fue del 100% en muestras rectales y del 97% en hisopos nasales.</p></span> <span id="abst0020" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0025">Conclusiones</span><p id="spar0020" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">El sistema AMR Direct Flow Chip® es un sistema rápido y eficaz para la detección de microorganismos multirresistentes a partir de muestras rectales y nasales.</p></span>" "secciones" => array:4 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "abst0005" "titulo" => "Introducción" ] 1 => array:2 [ "identificador" => "abst0010" "titulo" => "Métodos" ] 2 => array:2 [ "identificador" => "abst0015" "titulo" => "Resultados" ] 3 => array:2 [ "identificador" => "abst0020" "titulo" => "Conclusiones" ] ] ] "en" => array:3 [ "titulo" => "Abstract" "resumen" => "<span id="abst0025" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0035">Introduction</span><p id="spar0025" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">The main objective of this work is to carry out the clinical validation of the trial with the AMR Direct Flow Chip® starting from either nasal swabs, rectal swabs directly or from isolated strains to detect antibiotic resistance genes.</p></span> <span id="abst0030" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0040">Methods</span><p id="spar0030" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">We developed the preclinical validation of the assay with 104 known bacterial isolates. A total of 210 nasal or rectal swab samples were analyzed. The AMR assay is based on multiplex PCR followed by reverse dot blot hybridization on DNA arrays fully automated by using the HS24 platform. The completion time of the full analysis is 3 hours.</p></span> <span id="abst0035" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0045">Results</span><p id="spar0035" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">Both the sensitivity and specificity of the preclinical assay were 100%, with the 104 samples correctly identified. In the clinical validation, the sensitivity was 100% and the specificity was between 100% in rectal swabs and 97% in nasal swabs.</p></span> <span id="abst0040" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0050">Conclusions</span><p id="spar0040" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">The AMR Direct Flow Chip® is a rapid and effective assay for the detection of multidrug-resistant microorganisms from nasal and rectal swab samples.</p></span>" "secciones" => array:4 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "abst0025" "titulo" => "Introduction" ] 1 => array:2 [ "identificador" => "abst0030" "titulo" => "Methods" ] 2 => array:2 [ "identificador" => "abst0035" "titulo" => "Results" ] 3 => array:2 [ "identificador" => "abst0040" "titulo" => "Conclusions" ] ] ] ] "apendice" => array:1 [ 0 => array:1 [ "seccion" => array:1 [ 0 => array:4 [ "apendice" => "<p id="par0120" class="elsevierStylePara elsevierViewall"><elsevierMultimedia ident="upi0005"></elsevierMultimedia></p>" "etiqueta" => "Anexo A" "titulo" => "Material adicional" "identificador" => "sec0065" ] ] ] ] "multimedia" => array:4 [ 0 => array:7 [ "identificador" => "fig0005" "etiqueta" => "Figura 1" "tipo" => "MULTIMEDIAFIGURA" "mostrarFloat" => true "mostrarDisplay" => false "figura" => array:1 [ 0 => array:4 [ "imagen" => "gr1.jpeg" "Alto" => 1082 "Ancho" => 1514 "Tamanyo" => 100464 ] ] "descripcion" => array:1 [ "es" => "<p id="spar0045" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">Plataforma HS24 y <span class="elsevierStyleItalic">chip</span> AMR Direct Flow Chip®. A) Plataforma automatizada HS24 para el procesamiento de la hibridación reversa y análisis de la imagen. B) Resultados para una cepa de <span class="elsevierStyleItalic">Escherichia coli</span> productora de carbapenemasas. C) Detección de microorganismos MDR en un hisopo rectal positivo que albergaba <span class="elsevierStyleItalic">Klebsiella pneumoniae</span><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-48</span>/<span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">SHV</span> y <span class="elsevierStyleItalic">Acinetobacter baumannii</span><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-51</span>. Todas las sondas se disponen por duplicado en la matriz del <span class="elsevierStyleItalic">chip</span> y un resultado se considera positivo si se detectan ambas señales. Sondas positivas detectadas: control de biotina (BC); control exógeno de amplificación (IC), para la detección de ADN sintético incluido en el <span class="elsevierStyleItalic">mix</span> de la PCR; control endógeno de amplificación (BG), para la detección del gen <span class="elsevierStyleItalic">beta-globina</span> humano; <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">VIM</span> (VIM); <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">SHV</span> (SHV); <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-48</span> (OXA48) y <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-51</span> (OXA51). La imagen está ampliada ×5 en comparación con el tamaño real del <span class="elsevierStyleItalic">chip</span>.</p>" ] ] 1 => array:8 [ "identificador" => "tbl0005" "etiqueta" => "Tabla 1" "tipo" => "MULTIMEDIATABLA" "mostrarFloat" => true "mostrarDisplay" => false "detalles" => array:1 [ 0 => array:3 [ "identificador" => "at1" "detalle" => "Tabla " "rol" => "short" ] ] "tabla" => array:2 [ "leyenda" => "<p id="spar0055" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">BLEE: betalactamasas de espectro extendido.</p>" "tablatextoimagen" => array:1 [ 0 => array:1 [ "tabla" => array:1 [ 0 => """ <table border="0" frame="\n \t\t\t\t\tvoid\n \t\t\t\t" class=""><thead title="thead"><tr title="table-row"><th class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " colspan="2" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">Microorganismos</th><th class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t\t\t</th><th class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">Determinantes genéticos de resistencia \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t\t\t</th></tr></thead><tbody title="tbody"><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " rowspan="2" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">Bacterias grampositivas</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">Staphylococcus aureus</span> resistente a la meticilina \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">- \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">SA-<span class="elsevierStyleItalic">mec</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">Enterococcus</span> spp. resistentes a la vancomicina \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">- \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">vanA y vanB</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">Bacterias gramnegativas \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " rowspan="3" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Escherichia coli, Acinetobacter baumannii, Serratia marcescens, Enterobacter asburiae, Enterobacter cloacae</span> y <span class="elsevierStyleItalic">Pseudomonas aeruginosa</span></td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">Clase A \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">CTX-M</span>, <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">SHV</span>, <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">SME</span>, <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">KPC</span>, <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">NMC/IMI</span> y <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">GES</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " rowspan="2" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">Productoras de BLEE y de carbapenemasas</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">Clase B \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">IMP</span>, <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">GIM</span>, <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">VIM</span>, <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">SPM</span>, <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">SIM</span> y <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">NDM</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">Clase D \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-23-like</span>, <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-24-like</span>, <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-48-like</span>, <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA51-like</span> y <span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-58-like</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr></tbody></table> """ ] ] ] ] "descripcion" => array:1 [ "es" => "<p id="spar0050" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">Determinantes genéticos de resistencia detectados mediante el ensayo con el kit AMR Direct Flow Chip®</p>" ] ] 2 => array:8 [ "identificador" => "tbl0010" "etiqueta" => "Tabla 2" "tipo" => "MULTIMEDIATABLA" "mostrarFloat" => true "mostrarDisplay" => false "detalles" => array:1 [ 0 => array:3 [ "identificador" => "at2" "detalle" => "Tabla " "rol" => "short" ] ] "tabla" => array:2 [ "leyenda" => "<p id="spar0065" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">AMR: AMR Direct Flow Chip®; BLEE: betalactamasas de espectro extendido; ERV: enterococo resistente a vancomicina; IC95%: intervalo de confianza al 95%; SARM: <span class="elsevierStyleItalic">Staphylococcus aureus</span> resistente a meticilina.</p>" "tablatextoimagen" => array:1 [ 0 => array:1 [ "tabla" => array:1 [ 0 => """ <table border="0" frame="\n \t\t\t\t\tvoid\n \t\t\t\t" class=""><thead title="thead"><tr title="table-row"><th class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " colspan="2" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">Microorganismos resistentes</th><th class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">Número de muestras positivas \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t\t\t</th><th class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">Número de muestras detectadas por AMR \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t\t\t</th><th class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">Resultado AMR \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t\t\t</th><th class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">Sensibilidad (%) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t\t\t</th><th class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">IC95% \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t\t\t</th><th class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">Especificidad (%) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t\t\t</th><th class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">IC95% \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t\t\t</th></tr></thead><tbody title="tbody"><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " colspan="9" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleBold">Hisopos nasales (n</span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleBold">=</span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleBold">90)</span></td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleItalic">SARM</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">8 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">10 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">S. aureus</span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>+<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>mecA \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">59-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">97 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">90-99 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " colspan="9" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleBold">Hisopos rectales (n</span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleBold">=</span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleBold">120)</span></td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " colspan="9" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleItalic">BLEE</span></td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>K. pneumoniae<span class="elsevierStyleSup">12</span>, E. coli<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0100"><span class="elsevierStyleSup">10</span></a>, A. baumannii<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0055"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">CTX</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">23 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">23 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">CTX</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">82-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">95-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>K. pneumoniae<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0075"><span class="elsevierStyleSup">5</span></a> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">SHV</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">5 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">5 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">SHV</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">46-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">96-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>K. oxytoca<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0055"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">GES</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">1 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">1 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">GES</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">5-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">96-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>Productores de carbapenemasas \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">9 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">9 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">- \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">62-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">96-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>K. pneumoniae<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0080"><span class="elsevierStyleSup">6</span></a>, E. coli<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0060"><span class="elsevierStyleSup">2</span></a> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">VIM</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">8 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">8 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">VIM</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">60-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">95-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>A. baumannii<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0055"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-23</span>/<span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-51</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">1 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">1 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-23</span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>+<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleItalic">bla</span><span class="elsevierStyleInf">OXA-51</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">5-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">96-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleItalic">ERV</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">6 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">6 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">- \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">52-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">96-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>E. faecium<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0060"><span class="elsevierStyleSup">2</span></a> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">vanA</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">2 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">2 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">vanA</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">20-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">96-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td-with-role" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t ; entry_with_role_rowhead " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>E. faecium<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0065"><span class="elsevierStyleSup">3</span></a>, E. faecalis<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0055"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">vanB</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">4 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">4 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">vanB</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">40-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">96-100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr></tbody></table> """ ] ] ] ] "descripcion" => array:1 [ "es" => "<p id="spar0060" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">Sensibilidad y especificidad para los ensayos realizados empleando el kit AMR Direct Flow Chip® en hisopos nasales y rectales para la detección de determinantes genéticos de resistencia</p>" ] ] 3 => array:5 [ "identificador" => "upi0005" "tipo" => "MULTIMEDIAECOMPONENTE" "mostrarFloat" => false "mostrarDisplay" => true "Ecomponente" => array:2 [ "fichero" => "mmc1.pdf" "ficheroTamanyo" => 106827 ] ] ] "bibliografia" => array:2 [ "titulo" => "Bibliografía" "seccion" => array:1 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "bibs0015" "bibliografiaReferencia" => array:10 [ 0 => array:3 [ "identificador" => "bib0055" "etiqueta" => "1" "referencia" => array:1 [ 0 => array:2 [ "contribucion" => array:1 [ 0 => array:2 [ "titulo" => "Antibiotic resistance--The need for global solutions" "autores" => array:1 [ 0 => array:2 [ "etal" => true "autores" => array:6 [ 0 => "R. 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Original
Evaluación clínica de un nuevo método molecular para la detección de microorganismos multirresistentes
Clinical evaluation of a new molecular method for the detection of multidrug-resistant microorganisms
Alba de la Rica-Martíneza, María Andres-Francha, Gabriel Estan-Cerezob, Montserrat Ruiz-Garciaa, Juan Carlos Rodríguez-Díazc, Nieves Gonzalo-Jimeneza, Antonio Galiana-Cabreraa,
Autor para correspondencia
a Servicio de Microbiología, Hospital General Universitario de Elche, Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana (FISABIO), Elche, Alicante, España
b Unidad de Enfermedades Infecciosas, Hospital General Universitario de Elche, Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana (FISABIO), Elche, Alicante, España
c Servicio de Microbiología, Hospital General Universitario de Alicante, Instituto de Investigación Sanitaria y Biomédica de Alicante (ISABIAL), Alicante, España