Original
Espectrometría de masas matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight vs. metodología convencional en la identificación de Candida no-albicans
Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometry vs conventional methods in the identification of Candida non-albicans
Lucía Martínez-Lamas
, María Luisa Pérez del Molino, Fernanda Pardo, Eduardo Varela, Benito José Regueiro
Autor para correspondencia
Servicio de Microbiología y Parasitología, Complexo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, España
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Esta infección se asocia con un aumento en las tasas de morbilidad y mortalidad. Los estudios retrospectivos de cohortes con pacientes con candidemia y diferentes enfermedades de base cifran la mortalidad cruda entre un 30-81% y atribuible 50-71%. En estudios recientes la tasa de mortalidad cruda a las 12 semanas se sitúa en un 35,2%<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0020"><span class="elsevierStyleSup">4</span></a>, correspondiendo las tasas más elevadas a infecciones por <span class="elsevierStyleItalic">Candida no-albicans</span><a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0025"><span class="elsevierStyleSup">5,6</span></a>.</p><p id="par0010" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Existen diferencias en la epidemiología de la candidemia entre los diferentes países. En España, la incidencia se sitúa entre 0,76 y 0,81 por 100 ingresos, rango mayor al observado en otros países europeos, EE. UU. y Canadá. <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span> spp. es en frecuencia el sexto patógeno aislado en sangre, y la infección por este organismo supone un 10% de todas las infecciones con un número estimado de 4,3 episodios de candidemia por cada 1.000 habitantes<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0010"><span class="elsevierStyleSup">2</span></a>.</p><p id="par0015" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Aunque <span class="elsevierStyleItalic">Candida albicans</span> continúa siendo la especie más frecuente, se observa la emergencia de especies de <span class="elsevierStyleItalic">Candida no-albicans</span>, la aparición de especies resistentes a azoles y el desarrollo de resistencias secundarias en aislados previamente sensibles<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0035"><span class="elsevierStyleSup">7</span></a>. Este aumento se ha asociado con el uso de catéteres vasculares y de nutrición parenteral, neoplasia, neutropenia y exposición previa a azoles. <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span> causa la mayoría de procesos infecciosos debidos a especies <span class="elsevierStyleItalic">no-albicans</span>. En general la elección de profilaxis y recomendaciones terapéuticas se basan en la posible implicación de <span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> o <span class="elsevierStyleItalic">C. krusei</span>, resistentes a azoles<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0025"><span class="elsevierStyleSup">5,8</span></a>.</p><p id="par0020" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La identificación de levaduras se realiza habitualmente por métodos comerciales basados en la asimilación de carbohidratos como API ID 32C, API CAUX o mediante métodos automatizados como el sistema Vitek ID YST (BioMérieux, Marci L¿Étoile, Francia), así como mediante estudios morfológicos en agar harina de maíz o agar arroz, junto con la utilización de medios cromogénicos diferenciales. Entre los problemas de los métodos de identificación fenotípicos destacan su lentitud, condicionada por el crecimiento del hongo, la existencia de bases de datos limitadas y el gran número de identificaciones incorrectas proporcionadas por estos sistemas<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0005"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a>. Recientemente se han desarrollado alternativas basadas en técnicas de ADN como la PCR que han aumentado la rapidez diagnóstica y mejorado la capacidad de diferenciación entre especies. Debido a su elevado coste, mayor tiempo de realización y necesidad de personal experto para su interpretación, están en fase de adaptación a la práctica clínica<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0030"><span class="elsevierStyleSup">6</span></a>.</p><p id="par0025" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La importancia de la diferenciación de aislados desde el punto de vista epidemiológico y de la identificación rápida de las levaduras a nivel de especie, demanda un sistema que suponga un avance tecnológico en este campo<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0045"><span class="elsevierStyleSup">9</span></a>. En este contexto, el sistema de espectrometría de masas MALDI-TOF es una herramienta emergente capaz de proporcionar una identificación rápida de especies microbianas a partir de colonias aisladas, siendo incluso capaz de diferenciar a nivel de subespecie, como ha quedado demostrado en numerosos trabajos<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0050"><span class="elsevierStyleSup">10–12</span></a>.</p><p id="par0030" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El objetivo de este estudio es demostrar la aplicación del sistema MALDI-TOF en la identificación de especies de <span class="elsevierStyleItalic">Candida no-albicans</span> procedentes de aislados clínicos y comparar los resultados con los obtenidos por los métodos bioquímicos disponibles en la actualidad.</p></span><span id="sec0010" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle">Material y métodos</span><span id="sec0015" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle">Aislados clínicos</span><p id="par0035" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En el estudio se incluyeron los 73 aislados de <span class="elsevierStyleItalic">Candida no-albicans</span> obtenidos a partir de muestras invasivas recibidas en un período de dos años, entre mayo de 2008 y mayo 2010, en el Servicio de Microbiología del Complexo Hospitalario Universitario de Santiago de Compostela (CHUS). Las muestras se sembraron en medios de cultivo habituales de acuerdo con la metodología microbiológica convencional y se subcultivaron en agar Sabuoraud con 2% glucosa (Becton dickinson, Heidelberg, Alemania) y en CHROMagar <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span> (Becton dickinson, Heidelberg, Alemania) para su identificación presuntiva.</p></span><span id="sec0020" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle">Identificación bioquímica</span><p id="par0040" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La identificación bioquímica se realizó mediante el sistema automatizado Vitek-2 YST (BioMérieux, Marci L¿Étolie, Francia) y cuando el sistema no ofreció una identificación fiable con porcentajes superiores al 95%, se reidentificó mediante API CAUX (BioMérieux, Marci L¿Étolie, Francia).</p></span><span id="sec0025" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle">MALDI-TOF MS</span><p id="par0045" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Tras la incubación de los aislados 48 horas en agar Sabuoraud con 2% glucosa, se transfirieron 2-3 colonias a un tubo de extracción con tapón de rosca de 1,5<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>ml (Eppendorf, Alemania) mezclándose con 0,5<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>ml de etanol absoluto y se centrifugó a 10.000<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>rpm durante 10 minutos. El sedimento resultante se secó al aire y se mezcló con 50 ul de ácido fórmico al 25%. Se depositaron 0,5 ul del sobrenadante sobre la placa de MALDI-TOF MS y se dejó secar a temperatura ambiente. Por último, se añadió 0,5 ul de la matriz ácido 2,5-dihidroxibenzóico (DHB) para la precipitación de las proteínas y péptidos celulares.</p><p id="par0050" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Los espectros de picos se generaron con el sistema Axima Confidence (Shimadzu Corporation), utilizando el software Shimadzu Launchpad y la base de datos SARAMIS (AnagnosTec GmbH) para la medida e identificación automáticas. Los porcentajes de confianza en la identificación a nivel de familia, género y especie se generaron por comparación con los superespectros de la base de datos del sistema. Sólo los porcentajes mayores del 90% se consideraron válidos en este estudio. El espectrómetro se calibró externamente utilizando la cepa de <span class="elsevierStyleItalic">Escherichia coli</span> de referencia para el sistema.</p></span><span id="sec0030" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle">Análisis de las discrepancias</span><span id="sec0035" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle">Reidentificación de los aislados de <span class="elsevierStyleItalic">Candida parapsilosis</span></span><p id="par0055" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La redefinición del grupo taxonómico de <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span> incluye dos especies adicionales: <span class="elsevierStyleItalic">C. orthopsilosis</span> y <span class="elsevierStyleItalic">C. metapsilosis</span>, incluidas en las bases de datos del sistema MALDI-TOF MS. Para la reidentificación de los aislados de <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span> se utilizó el método de digestión con BanI del fragmento SADH <span class="elsevierStyleItalic">(secondary alcohol dehydrogenase)</span> descrito por Tavanti et al<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0065"><span class="elsevierStyleSup">13</span></a>.</p></span><span id="sec0040" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle">Reidentificación de los aislados de <span class="elsevierStyleItalic">Candida glabrata</span></span><p id="par0060" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Recientemente se ha constatado que fenotípicamente <span class="elsevierStyleItalic">Candida glabrata</span> puede comportarse como <span class="elsevierStyleItalic">Candida nivariensis</span> y <span class="elsevierStyleItalic">Candida bracariensis</span>. Con el fin de asegurar la identificación correcta de esta especie de <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span> y para el análisis de resultados discrepantes, se empleó una PCR específica de <span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> con los primeros CGL1 y CGL2 descritos previamente<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0070"><span class="elsevierStyleSup">14,15</span></a>.</p></span><span id="sec0045" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle">Identificación genotípica mediante PCR real-time multiplex</span><p id="par0065" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Para la confirmación de los resultados discrepantes por ambos métodos se utilizó el sistema LightCycler SeptiFast test M<span class="elsevierStyleSup">grade</span> (Roche Diagnostics GmbH), previa lisis mecánica por sistema MagnaLyser (Roche Diagnostics GmbH) y extracción con el sistema automático MagnaPure Compact (Roche Applied Science, GmbH), siguiendo las instrucciones del fabricante. Este sistema permite la identificación de 5 especies de <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span> sp. (<span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span>, <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span>, <span class="elsevierStyleItalic">C. krusei</span>, <span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> y <span class="elsevierStyleItalic">C. tropicalis</span>), mediante la amplificación de las regiones ITS <span class="elsevierStyleItalic">(internal transcribed spacer)</span> del ADN.</p></span></span></span><span id="sec0050" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle">Resultados</span><p id="par0070" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Los métodos bioquímicos identificaron de forma concluyente 67 de los 73 aislados de <span class="elsevierStyleItalic">Candida no-albicans</span> a nivel de especie y 6 a nivel de género. El sistema MALDI-TOF MS obtuvo identificaciones a nivel de especie en todas ellas con un porcentaje superior al 90%.</p><p id="par0075" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Se obtuvieron resultados concordantes en 35<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span>; 12<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span>; 5<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleItalic">C. krusei</span>; 3<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleItalic">C. tropicalis</span>; 1<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><span class="elsevierStyleItalic">C. lusitaniae</span>, y 1 <span class="elsevierStyleItalic">C. kefir</span>. La correlación en la especie de todos los aislados estudiados fue del 85,07%, llegando a un valor del 94,52% si se estudia la correlación entre la identificación obtenida mediante todas las técnicas de confirmación utilizadas respecto al sistema de espectrometría de masas MALDI-TOF (<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#tbl0005">tabla 1</a>).</p><elsevierMultimedia ident="tbl0005"></elsevierMultimedia><p id="par0080" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En diez aislados se encontraron discrepancias por ambos métodos. La ausencia de correlación se cifra en el 5,48% correspondientes a dos aislados no confirmados de <span class="elsevierStyleItalic">Pichia guillermondii</span> y otros dos en los que se obtuvo una identificación diferente por los cuatro métodos de confirmación (<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#tbl0010">tabla 2</a>).</p><elsevierMultimedia ident="tbl0010"></elsevierMultimedia><p id="par0085" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En los 38 aislados de <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span> identificados por los métodos convencionales, el sistema MALDI-TOF obtuvo una identificación de <span class="elsevierStyleItalic">C. orthopsilosis</span> en tres de ellos que se confirmaron como tales por el método de digestión con BanI del fragmento SADH.</p><p id="par0090" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Los resultados de los aislados que bioquímicamente se clasificaron como <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span> spp. se muestran en la <a class="elsevierStyleCrossRef" href="#tbl0015">tabla 3</a>.</p><elsevierMultimedia ident="tbl0015"></elsevierMultimedia></span><span id="sec0055" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle">Discusión</span><p id="par0095" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La identificación correcta y rápida de los hongos patógenos, aislados a partir de muestras clínicas es uno de los objetivos a alcanzar para el manejo correcto del paciente con candidemia y para el control de la infección fúngica invasora. Conociendo la variabilidad en la susceptibilidad a antifúngicos inherente a las diferentes especies de <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span>, la correcta identificación a nivel de especie es a menudo crítica para tomar decisiones terapéuticas.</p><p id="par0100" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Como se ha demostrado, la combinación de varios sistemas de identificación contribuye a la calidad y eficacia de la identificación llevada a cabo de forma convencional en el laboratorio de la especies de <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span><a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0080"><span class="elsevierStyleSup">16</span></a>. Los sistemas basados en la biología molecular presentan limitaciones relacionadas con su complejidad, fundamentalmente debido a la preparación de la muestra, la posibilidad de contaminación ambiental, aplicación limitada sobre muestra clínica directamente, etc. En la práctica, a pesar de su teórica rapidez y de surgir como alternativa a los métodos convencionales fenotípicos, se reservan como métodos confirmatorios<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0055"><span class="elsevierStyleSup">11</span></a>.</p><p id="par0105" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En este estudio se ha demostrado la utilidad del sistema MALDI-TOF que es capaz de proporcionar un espectro de picos para la identificación de <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span> sp. a nivel de género y especie<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0045"><span class="elsevierStyleSup">9</span></a>. La correlación entre este nuevo método y los métodos disponibles en el laboratorio ha alcanzado un valor mayor al 85%. El hecho de que este valor supere el 90% al combinar los diferentes métodos de confirmación de identificación pone de manifiesto tanto la superioridad del sistema MALDI-TOF, como el elevado número de errores atribuidos a los métodos convencionales empleados en el laboratorio; estos valores de correlación elevados son similares a los obtenidos en estudios previos<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0060"><span class="elsevierStyleSup">12</span></a>. No obstante, los estudios de aplicación de la espectrometría de masas para la identificación de especies fúngicas son más recientes que los llevados a cabo en bacterias, ya que es evidente que para obtener los espectros característicos en el caso de estos microorganismos se necesitan varios pasos previos de preparación de la muestra, que implican la lisis celular y que hacen el proceso más complejo que en el caso de las bacterias. Estudios recientes han demostrado que la fijación con alcohol permite obtener resultados reproducibles, además de favorecer la suspensión celular previa a la disposición de la muestra en la placa de MALDI-TOF. Este sistema comparado con otros métodos de lisis ha demostrado ser el mejor de ellos, resultando un método rápido y sencillo de preparación de muestras fúngicas<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0045"><span class="elsevierStyleSup">9</span></a>.</p><p id="par0110" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En nuestro estudio se pone de manifiesto que el uso de los sistemas bioquímicos, puede confundir los aislados de <span class="elsevierStyleItalic">C. famata</span> con <span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span>, no obstante, el número reducido de aislados incluidos en el trabajo refleja la necesidad de estudios posteriores que confirmen este hecho. Además, en concordancia con lo demostrado en otros trabajos<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0085"><span class="elsevierStyleSup">17</span></a>, el MALDI-TOF parece ser un sistema útil para la identificación de especies relacionadas como <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span>, <span class="elsevierStyleItalic">orthopsilosis</span> y <span class="elsevierStyleItalic">metapsilosis</span>. De los 38 aislados de <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span> clasificadas por los métodos convencionales, detectó el total de aislados de <span class="elsevierStyleItalic">C. orthopsilosis</span> confirmados posteriormente como tales por digestión enzimática. El interés en la caracterización correcta del grupo «<span class="elsevierStyleItalic">psilosis»</span> no es sólo epidemiológico, sino que es importante debido a las posibles diferencias en los estudios de sensibilidad a antifúngicos. Estas nuevas especies estrechamente relacionadas con <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span> han mostrado sensibilidades disminuidas a anfotericina B e incluso a las equinocandinas<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0090"><span class="elsevierStyleSup">18,19</span></a>. Del mismo modo se ha atribuido una virulencia menor a <span class="elsevierStyleItalic">C. metapsilosis</span> que a <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span> y <span class="elsevierStyleItalic">orthopsilosis</span><a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0065"><span class="elsevierStyleSup">13,16</span></a>. No obstante, la prevalencia de estas especies en España es todavía baja con valores que se sitúan entre 1,4-1,7%, como productoras de candidemia<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0090"><span class="elsevierStyleSup">18</span></a>.</p><p id="par0115" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Puesto que, este sistema ha demostrado la capacidad de diferenciar entre aislados del grupo «<span class="elsevierStyleItalic">psilosis»</span>, podría pensarse en la aplicación de este método para la discriminación de <span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span>, <span class="elsevierStyleItalic">C. nivariensis</span> y <span class="elsevierStyleItalic">C. bracariensis</span>, fenotípicamente indistinguibles. En los últimos años se ha observado un aumento en su incidencia, mostrando CMI elevadas a azoles y equinocandinas; por ello parece prudente buscar nuevos sistemas que permitan asignar de forma correcta su identificación con el fin de monitorizar estos patógenos con multirresistencia emergentes<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0100"><span class="elsevierStyleSup">20,21</span></a>.</p><p id="par0120" class="elsevierStylePara elsevierViewall">De forma global, la identificación mediante espectrometría de masas presenta varias ventajas fundamentales: sencillez en la preparación de muestra, no necesidad de tinción de gram, escaso volumen, rapidez en la obtención de resultados (once minutos) y el bajo coste a pesar de tratarse de un equipo caro con un precio es comparable al de otros equipos comunes en el laboratorio de microbiología y un coste de material fungible prácticamente nulo<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0050"><span class="elsevierStyleSup">10–12</span></a>. Una limitación de este sistema es que no proporciona datos de susceptibilidad a antimicrobianos, sin embargo, la resistencia a antibióticos depende de la producción de péptidos y proteínas específicas, por lo que la aplicación de los espectrómetros de masas en este campo es una futura posibilidad. Estudios recientes han demostrado la posibilidad y las ventajas de la aplicación del sistema MALDI-TOF sobre muestra clínica y hemocultivo positivo<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0110"><span class="elsevierStyleSup">22–24</span></a>. Existen publicaciones en los que se identificaron de forma correcta el 100% de los aislados de <span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span>. No obstante, en otros trabajos se pone de manifiesto la limitación de este nuevo método en la detección de fungemia por <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span> sp.<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0105"><span class="elsevierStyleSup">21,25</span></a>. Probablemente en relación con la baja concentración de microorganismos en sangre que en esta entidad clínica puede ser menor de 100 ufc/ml<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0080"><span class="elsevierStyleSup">16</span></a>.</p><p id="par0125" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Trabajos recientes han estudiado la aplicación de la espectrometría de masas en el tipado de <span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span> y <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span>, obteniéndose una elevada heterogeneidad entre los aislados estudiados, lo que refleja la elevada complejidad biológica de las levaduras y convierte al sistema MALDI-TOF en un complemento de las herramientas de tipado disponibles, importante para conocer los patrones de dispersión de la infección fúngica desde el punto de vista epidemiológico, lo que amplia todavía más las aplicaciones de este nuevo método<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0110"><span class="elsevierStyleSup">22</span></a>.</p><p id="par0130" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En el futuro podría plantearse como método previo a la secuenciación del 16S reduciéndose así el coste y tiempo necesarios para la identificación microbiológica. No obstante, en la actualidad esta aplicación pasa por la necesidad de mejora, ampliación y consenso de las bases de datos de los principales patógenos humanos disponibles por el sistema<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0055"><span class="elsevierStyleSup">11,12,26</span></a>.</p></span><span id="sec0060" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle">Conflicto de intereses</span><p id="par0135" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Los autores declaran no tener ningún conflicto de intereses.</p></span></span>" "textoCompletoSecciones" => array:1 [ "secciones" => array:10 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "xres150664" "titulo" => array:5 [ 0 => "Resumen" 1 => "Introducción" 2 => "Métodos" 3 => "Resultados" 4 => "Conclusión" ] ] 1 => array:2 [ "identificador" => "xpalclavsec138608" "titulo" => "Palabras clave" ] 2 => array:2 [ "identificador" => "xres150665" "titulo" => array:5 [ 0 => "Abstract" 1 => "Introduction" 2 => "Methods" 3 => "Results" 4 => "Conclusion" ] ] 3 => array:2 [ "identificador" => "xpalclavsec138607" "titulo" => "Keywords" ] 4 => array:2 [ "identificador" => "sec0005" "titulo" => "Introducción" ] 5 => array:3 [ "identificador" => "sec0010" "titulo" => "Material y métodos" "secciones" => array:4 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "sec0015" "titulo" => "Aislados clínicos" ] 1 => array:2 [ "identificador" => "sec0020" "titulo" => "Identificación bioquímica" ] 2 => array:2 [ "identificador" => "sec0025" "titulo" => "MALDI-TOF MS" ] 3 => array:3 [ "identificador" => "sec0030" "titulo" => "Análisis de las discrepancias" "secciones" => array:3 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "sec0035" "titulo" => "Reidentificación de los aislados de Candida parapsilosis" ] 1 => array:2 [ "identificador" => "sec0040" "titulo" => "Reidentificación de los aislados de Candida glabrata" ] 2 => array:2 [ "identificador" => "sec0045" "titulo" => "Identificación genotípica mediante PCR real-time multiplex" ] ] ] ] ] 6 => array:2 [ "identificador" => "sec0050" "titulo" => "Resultados" ] 7 => array:2 [ "identificador" => "sec0055" "titulo" => "Discusión" ] 8 => array:2 [ "identificador" => "sec0060" "titulo" => "Conflicto de intereses" ] 9 => array:1 [ "titulo" => "Bibliografía" ] ] ] "pdfFichero" => "main.pdf" "tienePdf" => true "fechaRecibido" => "2010-11-27" "fechaAceptado" => "2011-03-29" "PalabrasClave" => array:2 [ "es" => array:1 [ 0 => array:4 [ "clase" => "keyword" "titulo" => "Palabras clave" "identificador" => "xpalclavsec138608" "palabras" => array:3 [ 0 => "<span class="elsevierStyleItalic">Candida no-albicans</span>" 1 => "<span class="elsevierStyleItalic">Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight</span>" 2 => "Espectrometría de masas" ] ] ] "en" => array:1 [ 0 => array:4 [ "clase" => "keyword" "titulo" => "Keywords" "identificador" => "xpalclavsec138607" "palabras" => array:3 [ 0 => "<span class="elsevierStyleItalic">Candida non-albicans</span>" 1 => "Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight" 2 => "Mass spectrometry" ] ] ] ] "tieneResumen" => true "resumen" => array:2 [ "es" => array:2 [ "titulo" => "Resumen" "resumen" => "<span class="elsevierStyleSectionTitle">Introducción</span><p id="spar0005" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">La infección por <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span> se ha convertido en un importante problema de salud en todo el mundo. La epidemiología de la candidemia se ha modificado considerablemente por la emergencia de las especies de <span class="elsevierStyleItalic">Candida no-albicans</span>. Esta variación tiene especial importancia en la elección de la profilaxis y tratamiento empírico. Los métodos bioquímicos y los basados en biología molecular presentan limitaciones para la identificación correcta de las especies de <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span>. El objetivo de este estudio es demostrar la capacidad del sistema de espectrometría de masas MALDI-TOF para la identificación de estas especies y compararlo con la tecnología utilizada en la actualidad<span class="elsevierStyleItalic">.</span></p> <span class="elsevierStyleSectionTitle">Métodos</span><p id="spar0010" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">Se incluyeron todos los aislados recogidos durante dos años (n<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>=<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>73) de <span class="elsevierStyleItalic">Candida no-albicans</span> procedentes de muestras invasivas. La identificación se realizó mediante los sistemas Vitek-2 YST y API CAUX. Las identificaciones del MALDI-TOF se hicieron con el sistema Axima Confidence (Shimadzu Corporation), utilizando el software Shimadzu Launchpad y la base de datos SARAMIS (AnagnosTec GmbH). Las discrepancias se resolvieron mediante PCR multiplex LightCycler SeptiFast, PCR específica de <span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> y digestión enzimática con BanI del fragmento SADH en los aislados de <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span>.</p> <span class="elsevierStyleSectionTitle">Resultados</span><p id="spar0015" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">De los 73 aislados de <span class="elsevierStyleItalic">Candida no-albicans</span>, los métodos bioquímicos identificaron de forma concluyente 67 a nivel de especie y 6 a nivel de género. El sistema MALDI-TOF obtuvo identificaciones a nivel de especie en todas ellas. La correlación en la especie de todos los aislados estudiados fue del 85,07%, llegando al 94,52% si se estudia la correlación entre la identificación obtenida mediante métodos bioquímicos junto con los métodos empleados para el análisis de las discrepancias. En los aislados de <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span>, el sistema MALDI-TOF obtuvo una identificación de <span class="elsevierStyleItalic">C. orthopsilosis</span> en tres de ellos, confirmándose por digestión con BanI del fragmento SADH.</p> <span class="elsevierStyleSectionTitle">Conclusión</span><p id="spar0020" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">En este estudio se ha demostrado la utilidad de la espectrometría de masas (sistema MALDI-TOF) para dotar al laboratorio de microbiología de una mayor eficiencia y fiabilidad para la identificación a nivel de especie de los aislados de <span class="elsevierStyleItalic">Candida no-albicans. A</span>demás de mostrar su posible utilidad para la identificación de especies relacionadas como <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span>, <span class="elsevierStyleItalic">orthopsilosis</span> y <span class="elsevierStyleItalic">metapsilosis</span>.</p>" ] "en" => array:2 [ "titulo" => "Abstract" "resumen" => "<span class="elsevierStyleSectionTitle">Introduction</span><p id="spar0025" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall"><span class="elsevierStyleItalic">Candida</span> infection has become a major health problem worldwide. The epidemiology of Candidaemia has substantially changed by the emergence of the species <span class="elsevierStyleItalic">Candida non-albicans</span>. This variation is particularly important in the choice of prophylaxis and empirical treatment. The methods based on biochemical and molecular biology have limitations for the correct identification of <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span> species. The aim of this study is to demonstrate the ability of the MALDI-TOF mass spectrometry for the identification of these species and compare it with the technology used today.</p> <span class="elsevierStyleSectionTitle">Methods</span><p id="spar0030" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">We included all isolates collected over 2 years (n=73) of <span class="elsevierStyleItalic">Candida non-albicans</span> from non-invasive samples. The identification was carried out by Vitek-2 systems YST and API CAUX. The MALDI-TOF identifications were made with Confidence Axima system (Shimadzu Corporation) using the Shimadzu Launchpad software and database SARAMIS (AnagnosTec GmbH). Discrepancies were resolved by SeptiFast LightCycler multiplex PCR, specific PCR <span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> and enzymatic digestion with BanI SADH fragment in isolates of <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span>.</p> <span class="elsevierStyleSectionTitle">Results</span><p id="spar0035" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">Of the 73 isolates of <span class="elsevierStyleItalic">Candida non-albicans</span>, the biochemical methods conclusively identified 67 to species level and 6 at the genus level. The MALDI-TOF system obtained identifications at the species level in all cases. The correlation in the species of all isolates studied was 85.07%, reaching 94.52% when the correlation was made between the identification obtained by biochemical methods and the methods for the analysis of the discrepancies. In isolates of <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span>, MALDI-TOF system obtained an identification of <span class="elsevierStyleItalic">C. orthopsilosis.</span> In 3 of them it was confirmed by digestion with BanI SADH fragment.</p> <span class="elsevierStyleSectionTitle">Conclusion</span><p id="spar0040" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">This study has demonstrated the use of mass spectrometry (MALDI-TOF system) to provide the microbiology laboratory with greater efficiency and reliability to identify isolates of <span class="elsevierStyleItalic">Candida non-albicans</span> to species level. It also shows its potential usefulness in identifying related species, such as <span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span>, <span class="elsevierStyleItalic">metapsilosis</span> and <span class="elsevierStyleItalic">orthopsilosis</span>.</p>" ] ] "multimedia" => array:3 [ 0 => array:7 [ "identificador" => "tbl0005" "etiqueta" => "Tabla 1" "tipo" => "MULTIMEDIATABLA" "mostrarFloat" => true "mostrarDisplay" => false "tabla" => array:2 [ "leyenda" => "<p id="spar0050" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">NP: no procede.</p>" "tablatextoimagen" => array:1 [ 0 => array:2 [ "tabla" => array:1 [ 0 => """ <table border="0" frame="\n \t\t\t\t\tvoid\n \t\t\t\t" class=""><thead title="thead"><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" style="border-bottom: 2px solid black">Identificación convencional (n.° cepas) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" style="border-bottom: 2px solid black">Identificación MALDI-TOF (n.° cepas) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" style="border-bottom: 2px solid black">Correlación en la especie, % \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr></thead><tbody title="tbody"><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " rowspan="2" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span> (38)</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span> (35) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">92,1 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. orthopsilosis</span> (3) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> (12) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> (12) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " rowspan="3" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. krusei</span> (7)</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. krusei</span> (5) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">71,4 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " rowspan="2" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. famata</span> (3)</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span> (2) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">0 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. Krusei</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. tropicalis</span> (3) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. tropicalis</span> (3) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. lusitaniae</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. lusitaniae</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. sphaerica</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">0 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. dubliniensis</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. keffir</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. keffir</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">100 \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " rowspan="4" align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">Candida</span> spp. (6)</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">Pichia guillermondii</span> (2) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> (2) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. krusei</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr></tbody></table> """ ] "imagenFichero" => array:1 [ 0 => "xTab244771.png" ] ] ] ] "descripcion" => array:1 [ "es" => "<p id="spar0045" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">Comparación de la identificación de 73 <span class="elsevierStyleItalic">Candida</span>s <span class="elsevierStyleItalic">no-albicans</span> mediante métodos microbiológicos convencionales y mediante espectrometría de masas <span class="elsevierStyleItalic">matrix-assisted laser desortion ionization time-of-flight</span></p>" ] ] 1 => array:7 [ "identificador" => "tbl0010" "etiqueta" => "Tabla 2" "tipo" => "MULTIMEDIATABLA" "mostrarFloat" => true "mostrarDisplay" => false "tabla" => array:2 [ "leyenda" => "<p id="spar0060" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">NP: no procede.</p>" "tablatextoimagen" => array:1 [ 0 => array:2 [ "tabla" => array:1 [ 0 => """ <table border="0" frame="\n \t\t\t\t\tvoid\n \t\t\t\t" class=""><thead title="thead"><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" style="border-bottom: 2px solid black">Identificación bioquímica (n.° cepas) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" style="border-bottom: 2px solid black">Identificación MALDI-TOF (n.° cepas) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" style="border-bottom: 2px solid black">PCR <span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> específica \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" style="border-bottom: 2px solid black">PCR LightCycler SeptiFast (n.° cepas) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" style="border-bottom: 2px solid black">SADH \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr></thead><tbody title="tbody"><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. famata</span> (2) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span> (2) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span> (2) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. krusei</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. sphaerica</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">+ \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. krusei</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">+ \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. famata</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. krusei</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. dubliniensis</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">+ \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. parapsilosis</span> (3) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. orthopsilosis</span> (3) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">+ \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr></tbody></table> """ ] "imagenFichero" => array:1 [ 0 => "xTab244772.png" ] ] ] ] "descripcion" => array:1 [ "es" => "<p id="spar0055" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">Discrepancias obtenidas entre los métodos convencionales y el sistema MALDI-TOF</p>" ] ] 2 => array:7 [ "identificador" => "tbl0015" "etiqueta" => "Tabla 3" "tipo" => "MULTIMEDIATABLA" "mostrarFloat" => true "mostrarDisplay" => false "tabla" => array:2 [ "leyenda" => "<p id="spar0070" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">NP: no procede.</p>" "tablatextoimagen" => array:1 [ 0 => array:2 [ "tabla" => array:1 [ 0 => """ <table border="0" frame="\n \t\t\t\t\tvoid\n \t\t\t\t" class=""><thead title="thead"><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" style="border-bottom: 2px solid black">Identificación MALDI-TOF (n.° cepas) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" style="border-bottom: 2px solid black">PCR <span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> específica \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-head\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t" style="border-bottom: 2px solid black">PCR LightCycler SeptiFast \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr></thead><tbody title="tbody"><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">Pichia guillermondii</span> (2) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">− \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. glabrata</span> (2) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">+ \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t">NP \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. albicans</span> \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td></tr><tr title="table-row"><td class="td" title="\n \t\t\t\t\ttable-entry\n \t\t\t\t " align="left" valign="\n \t\t\t\t\ttop\n \t\t\t\t"><span class="elsevierStyleItalic">C. krusei</span> (1) \t\t\t\t\t\t\n \t\t\t\t</td><td 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|---|---|---|---|
| 2024 Octubre | 7 | 7 | 14 |
| 2024 Septiembre | 16 | 15 | 31 |
| 2024 Agosto | 23 | 16 | 39 |
| 2024 Julio | 15 | 11 | 26 |
| 2024 Junio | 14 | 10 | 24 |
| 2024 Mayo | 33 | 26 | 59 |
| 2024 Abril | 27 | 17 | 44 |
| 2024 Marzo | 32 | 14 | 46 |
| 2024 Febrero | 34 | 10 | 44 |
| 2024 Enero | 23 | 23 | 46 |
| 2023 Diciembre | 21 | 33 | 54 |
| 2023 Noviembre | 21 | 45 | 66 |
| 2023 Octubre | 44 | 37 | 81 |
| 2023 Septiembre | 50 | 28 | 78 |
| 2023 Agosto | 12 | 22 | 34 |
| 2023 Julio | 19 | 25 | 44 |
| 2023 Junio | 15 | 5 | 20 |
| 2023 Mayo | 25 | 4 | 29 |
| 2023 Abril | 29 | 8 | 37 |
| 2023 Marzo | 22 | 6 | 28 |
| 2023 Febrero | 45 | 6 | 51 |
| 2023 Enero | 23 | 9 | 32 |
| 2022 Diciembre | 23 | 10 | 33 |
| 2022 Noviembre | 37 | 18 | 55 |
| 2022 Octubre | 19 | 9 | 28 |
| 2022 Septiembre | 18 | 45 | 63 |
| 2022 Agosto | 23 | 9 | 32 |
| 2022 Julio | 22 | 8 | 30 |
| 2022 Junio | 26 | 10 | 36 |
| 2022 Mayo | 16 | 17 | 33 |
| 2022 Abril | 27 | 19 | 46 |
| 2022 Marzo | 38 | 11 | 49 |
| 2022 Febrero | 21 | 7 | 28 |
| 2022 Enero | 64 | 7 | 71 |
| 2021 Diciembre | 40 | 11 | 51 |
| 2021 Noviembre | 33 | 11 | 44 |
| 2021 Octubre | 32 | 10 | 42 |
| 2021 Septiembre | 15 | 11 | 26 |
| 2021 Agosto | 23 | 10 | 33 |
| 2021 Julio | 31 | 7 | 38 |
| 2021 Junio | 19 | 21 | 40 |
| 2021 Mayo | 17 | 13 | 30 |
| 2021 Abril | 26 | 32 | 58 |
| 2021 Marzo | 30 | 24 | 54 |
| 2021 Febrero | 24 | 8 | 32 |
| 2021 Enero | 21 | 16 | 37 |
| 2020 Diciembre | 16 | 17 | 33 |
| 2020 Noviembre | 13 | 12 | 25 |
| 2020 Octubre | 25 | 8 | 33 |
| 2020 Septiembre | 30 | 15 | 45 |
| 2020 Agosto | 26 | 13 | 39 |
| 2020 Julio | 8 | 4 | 12 |
| 2020 Junio | 16 | 12 | 28 |
| 2020 Mayo | 23 | 13 | 36 |
| 2020 Abril | 11 | 10 | 21 |
| 2020 Marzo | 18 | 8 | 26 |
| 2020 Febrero | 46 | 9 | 55 |
| 2020 Enero | 25 | 19 | 44 |
| 2019 Diciembre | 21 | 16 | 37 |
| 2019 Noviembre | 18 | 14 | 32 |
| 2019 Octubre | 16 | 10 | 26 |
| 2019 Septiembre | 25 | 9 | 34 |
| 2019 Agosto | 27 | 12 | 39 |
| 2019 Julio | 26 | 34 | 60 |
| 2019 Junio | 41 | 42 | 83 |
| 2019 Mayo | 119 | 100 | 219 |
| 2019 Abril | 60 | 48 | 108 |
| 2019 Marzo | 28 | 11 | 39 |
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| 2018 Diciembre | 46 | 13 | 59 |
| 2018 Noviembre | 54 | 21 | 75 |
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| 2018 Julio | 11 | 1 | 12 |
| 2018 Junio | 12 | 6 | 18 |
| 2018 Mayo | 13 | 14 | 27 |
| 2018 Abril | 9 | 4 | 13 |
| 2018 Marzo | 4 | 1 | 5 |
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| 2017 Noviembre | 13 | 3 | 16 |
| 2017 Octubre | 20 | 5 | 25 |
| 2017 Septiembre | 9 | 1 | 10 |
| 2017 Agosto | 24 | 0 | 24 |
| 2017 Julio | 9 | 3 | 12 |
| 2017 Junio | 12 | 6 | 18 |
| 2017 Mayo | 21 | 12 | 33 |
| 2017 Abril | 18 | 3 | 21 |
| 2017 Marzo | 12 | 31 | 43 |
| 2017 Febrero | 21 | 3 | 24 |
| 2017 Enero | 9 | 2 | 11 |
| 2016 Diciembre | 34 | 4 | 38 |
| 2016 Noviembre | 40 | 3 | 43 |
| 2016 Octubre | 52 | 11 | 63 |
| 2016 Septiembre | 45 | 7 | 52 |
| 2016 Agosto | 45 | 5 | 50 |
| 2016 Julio | 35 | 2 | 37 |
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| 2016 Mayo | 39 | 25 | 64 |
| 2016 Abril | 34 | 6 | 40 |
| 2016 Marzo | 37 | 13 | 50 |
| 2016 Febrero | 22 | 11 | 33 |
| 2016 Enero | 31 | 10 | 41 |
| 2015 Diciembre | 30 | 7 | 37 |
| 2015 Noviembre | 34 | 3 | 37 |
| 2015 Octubre | 31 | 8 | 39 |
| 2015 Septiembre | 26 | 7 | 33 |
| 2015 Agosto | 18 | 9 | 27 |
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| 2015 Junio | 9 | 6 | 15 |
| 2015 Mayo | 31 | 7 | 38 |
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| 2015 Febrero | 36 | 6 | 42 |
| 2015 Enero | 23 | 3 | 26 |
| 2014 Diciembre | 47 | 6 | 53 |
| 2014 Noviembre | 52 | 2 | 54 |
| 2014 Octubre | 48 | 3 | 51 |
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| 2013 Diciembre | 49 | 3 | 52 |
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| 2012 Noviembre | 3 | 0 | 3 |
| 2012 Octubre | 4 | 0 | 4 |
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