Carta científica
Bacteriemia por Desulfovibrio porci. Nuevo patógeno anaerobio asociado a enterocolitis infecciosa
Bacteremia due to Desulfovibrio porci. Novel anaerobic pathogen associated with infectious enterocolitis
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Los números sobre las ramas indican la frecuencia de agrupamiento de los taxones.</p>" ] ] ] "textoCompleto" => "<span class="elsevierStyleSections"><p id="par0005" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Los microorganismos del género <span class="elsevierStyleItalic">Desulfovibrio</span> son bacilos gramnegativos anaerobios estrictos, curvados y espirilados, con capacidad de reducir los compuestos con azufre a sulfuro de hidrógeno. Presentes en el medioambiente y forman parte de la flora del tracto gastrointestinal humano<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0030"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a>. Se han descrito, raramente, casos de bacteriemias primarias (traslocación intestinal) y de infecciones intraabdominales, habitualmente, por <span class="elsevierStyleItalic">Desulfovibrio desulfuricans (D. desulfuricans)</span> y <span class="elsevierStyleItalic">Desulfovibrio fairfieldensis</span><a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0035"><span class="elsevierStyleSup">2</span></a>. Son microorganismos de crecimiento muy lento en anaerobiosis y con resistencia intrínseca a antimicrobianos betalactámicos, incluyendo piperacilina/tazobactam<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0040"><span class="elsevierStyleSup">3</span></a>. <span class="elsevierStyleItalic">Desulfovibrio porci (D. porci)</span> es una nueva especie descrita recientemente (<a href="https://lpsn.dsmz.de/species/desulfovibrio-porci">https://lpsn.dsmz.de/species/desulfovibrio-porci</a>) en el tracto gastrointestinal del cerdo<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0045"><span class="elsevierStyleSup">4</span></a>, no habiendo casos descritos de infecciones en humanos.</p><p id="par0010" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Presentamos 2 casos de bacteriemia por <span class="elsevierStyleItalic">D. porci</span> en pacientes con enterocolitis y sepsis.</p><p id="par0015" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Caso 1. Mujer de 65 años trasplantada hepática en tratamiento con micofenolato y tacrolimus, que acude a urgencias en agosto de 2023 tras 2-3 días de diarreas sin productos patológicos, y vómitos, con antecedentes de trasplante hepático en diciembre de 2014. A la exploración se objetiva que no presenta fiebre pero sí deshidratación y taquipnea, abdomen blando y depresible, a la vez que presenta dolor abdominal tipo cólico y oligoanuria, sin datos de peritonismo, acidosis metabólica e insuficiencia renal aguda. En la TAC hay signos claros de enterocolitis. Se inicia en urgencias fluidoterapia y antibioterapia con piperacilina/tazobactam. Desarrolla shock séptico de origen abdominal, ingresando en UCI con mala evolución con fallo multiorgánico y, finalmente, éxitus, diagnosticándose como shock séptico por enterocolitis infecciosa<span class="elsevierStyleCrossOut">,</span> falleciendo en menos de 24 horas desde el ingreso hospitalario.</p><p id="par0020" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Caso 2. Varón de 64 años, sin antecedentes de interés, que acude a urgencias en enero de 2022 por dolor abdominal y diarrea sin productos patológicos de 5 días de evolución, un episodio de rectorragia autolimitada e insuficiencia renal aguda. No refiere fiebre. A la exploración, se aprecia dolor difuso abdominal, sin sangrado activo en el tacto rectal, deshidratación, taquipnea, abdomen distendido sin peritonismo, anuria y acidosis metabólica. En la TAC hay signos claros de enterocolitis. Desarrolla shock séptico de origen abdominal, instaurándose tratamiento con piperacilina/tazobactam y evolucionando mal con hipotensión refractaria, anuria, fallo hemodinámico y cardiaco derivando en éxitus en menos de 24 horas a pesar del tratamiento antibiótico en observación de urgencias, por shock séptico refractario y enterocolitis.</p><p id="par0025" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En ambos casos, en los hemocultivos extraídos en urgencias (sistema BACTEC FX, Becton-Dickinson, 2 sets que constan de un frasco aerobio, BACTEC Plus Aerobic/F y uno anaerobio, BACTEC Lytic/10 Anaerobic/F) hubo detección de crecimiento en un frasco anaerobio en el 5.° día de incubación, observándose en la tinción de Gram bacilos gramnegativos curvados, con poca afinidad por el contracolorante. Se subcultivaron en placas de agar sangre Columbia y agar chocolate (ThermoFisher) a 35<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>°<span class="elsevierStyleSmallCaps">C</span> en atmósfera aerobia con 5% de CO<span class="elsevierStyleInf">2</span> y placas de Schaedler (ThermoFisher) a 35° en atmósfera anaeróbica (Genbox anaer, BioMerieux), creciendo en las placas de anaerobiosis a las 72 horas de incubación, unas colonias muy pequeñas puntiformes, transparentes, de bordes lisos y no hemolíticas. La identificación con espectrometría de masas (MALDI-TOF, Bruker), no proporcionó ningún resultado.</p><p id="par0030" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En los 2 casos se hizo estudio microbiológico de las heces, en uno cultivo bacteriológico y en el otro detección molecular mediante PCR múltiplex (QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2, Qiagen), no detectándose ningún patógeno.</p><p id="par0035" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Para su asignación taxonómica se remitió la cepa al Laboratorio de Referencia e Investigación en Taxonomía del Centro Nacional de Microbiología (Instituto de Salus Carlos III)<span class="elsevierStyleItalic">.</span> La identificación de las cepas se lleva a cabo mediante análisis de la secuencia del gen <span class="elsevierStyleItalic">16S rARN</span> utilizando E781 y U1115 como primers y el secuenciador Applied Biosystems DNA Analyzer 3730xl. Para la cepa CNM20220034 (caso 1), se obtiene una secuencia de 1304pb que, al ser comparada con las secuencias de las cepas tipo depositadas en la base de datos de GeneBank (<a href="https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi"><span class="elsevierStyleUnderline">https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi</span></a>), presenta un porcentaje de identidad del 99,2% con la cepa tipo de <span class="elsevierStyleItalic">D. porci</span> (PG-178-WT-4). Para la cepa CNM20231004 (caso 2), se obtiene una secuencia de 1409pb con un porcentaje de identidad del 99,2% (<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#fig0005">Figura</a>). El alineamiento de las secuencias de CNM20220034, CNM20231004 y de la cepa tipo de <span class="elsevierStyleItalic">D. porci</span> utilizando Clustal W (DNAStar Lasergene 15), muestra un porcentaje de identidad del 100% entre las dos cepas.</p><elsevierMultimedia ident="fig0005"></elsevierMultimedia><p id="par0040" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El antibiograma se realizó mediante método epsilométrico (E-Test, Bio-Merieux) en agar <span class="elsevierStyleItalic">Brucella</span> HK solo en el primero de los casos, detectándose resistencia a penicilina (CMI<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>>32<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>mg/L), amoxicilina/clavulánico (CMI<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>>256<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>mg/L), piperacilina/tazobactam (CMI<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>>256<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>mg/L) y sensibilidad a imipenem (CMI<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>=<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>1<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>mg/L), clindamicina (CMI<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>=<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>0,5<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>mg/L) y metronidazol (CMI<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span><<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>=<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>0,016<span class="elsevierStyleHsp" style=""></span>mg/L). Se siguieron los criterios del CLSI (M100, Ed. 33) para la interpretación clínica de las CMI.</p><p id="par0045" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Los dos casos son pacientes con enterocolitis graves con ingreso hospitalario, desarrollando shock séptico y falleciendo en menos de 24 horas. El tratamiento antimicrobiano con piperacilina/tazobactam, muy habitual en infecciones intraabdominales, no sería adecuado para infecciones por <span class="elsevierStyleItalic">Desulfovibrio</span> spp., intrínsecamente resistente a este.</p><p id="par0050" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Para el diagnóstico de infecciones por <span class="elsevierStyleItalic">Desulfovibirio</span> spp. es importante recordar la necesidad de extraer frascos de hemocultivos en anaerobiosis, en caso de enterocolitis, incubarlos al menos 5 días, realizar tinción de Gram a todos los frascos de hemocultivo con detección de crecimiento, dejar en incubación durante 72 horas las placas de agar en atmósfera anaeróbica tras haber observado los microorganismos en la tinción y realizar la asignación taxonómica mediante dianas moleculares en los microorganismos no identificados por métodos habituales (pruebas bioquímicas, espectrometría de masas…). Añadir que, las técnicas comerciales de PCR múltiples tampoco identificarían estos microorganismos por no tenerlos incluidos en sus dianas.</p><p id="par0055" class="elsevierStylePara elsevierViewall"><span class="elsevierStyleItalic">D. porci</span> es un microorganismo anaerobio de muy lenta y difícil detección en hemocultivos que podría estar implicado en casos graves de enterocolitis infecciosas con sepsis. La implicación clínica de este microorganismo podría estar subestimada si no se procesan correctamente los hemocultivos, debido a su lento crecimiento en medios líquidos y sólidos, su difícil visualización en tinción de Gram y la difícil identificación al no estar incluidos en las bases de datos de los sistemas comerciales, requiriendo la aplicación de dianas moleculares con valor taxonómico como el gen <span class="elsevierStyleItalic">16S rARN</span>.</p><p id="par0060" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En general, la bacteriemia por microorganismos del género <span class="elsevierStyleItalic">Desulfovibrio</span> se produce por las especies <span class="elsevierStyleItalic">D. desulfuricans</span> y <span class="elsevierStyleItalic">D. fairfieldensis</span>, por translocación bacteriana del tracto gastrointestinal en pacientes con patología colónica, siendo la evolución buena en la mayoría de los casos<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0050"><span class="elsevierStyleSup">5</span></a>.</p><p id="par0065" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En nuestros casos, la bacteriemia por <span class="elsevierStyleItalic">D. porci</span>, se asocia con enterocolitis (sin poder asegurar si la infección por <span class="elsevierStyleItalic">D. porci</span> es la causa de la enterocolitis, o la bacteriemia es la consecuencia de la patología intestinal), sepsis grave y fallecimiento de los dos pacientes por shock séptico.</p><span id="sec0010" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0005">Financiación</span><p id="par0070" class="elsevierStylePara elsevierViewall">No existe financiación para este estudio.</p></span></span>" "textoCompletoSecciones" => array:1 [ "secciones" => array:2 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "sec0010" "titulo" => "Financiación" ] 1 => array:1 [ "titulo" => "Bibliografía" ] ] ] "pdfFichero" => "main.pdf" "tienePdf" => true "multimedia" => array:1 [ 0 => array:7 [ "identificador" => "fig0005" "etiqueta" => "Figura 1" "tipo" => "MULTIMEDIAFIGURA" "mostrarFloat" => true "mostrarDisplay" => false "figura" => array:1 [ 0 => array:4 [ "imagen" => "gr1.jpeg" "Alto" => 1179 "Ancho" => 1967 "Tamanyo" => 122477 ] ] "descripcion" => array:1 [ "es" => "<p id="spar0005" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">Árbol filogenético realizado con las secuencias del 16S rARN (1245 bp) de las cepas CNM20220034 (caso 1) y CNM20231004 (caso 2) y con respecto a las cepas tipo de las diferentes especies relacionadas del género <span class="elsevierStyleItalic">Desulfovibrio</span> (MEGA7, método de Maximum Likelihood basado en el modelo de Tamura-Nei, 1000 réplicas, longitud de las ramas calculada según el número de sustituciones por posición). Los números sobre las ramas indican la frecuencia de agrupamiento de los taxones.</p>" ] ] ] "bibliografia" => array:2 [ "titulo" => "Bibliografía" "seccion" => array:1 [ 0 => array:2 [ "identificador" => "bibs0015" "bibliografiaReferencia" => array:5 [ 0 => array:3 [ "identificador" => "bib0030" "etiqueta" => "1" "referencia" => array:1 [ 0 => array:2 [ "contribucion" => array:1 [ 0 => array:2 [ "titulo" => "<span class="elsevierStyleItalic">Desulfovibrio</span> in the Gut: The Enemy within?" "autores" => array:1 [ 0 => array:2 [ "etal" => false "autores" => array:3 [ 0 => "S.B. Singh" 1 => "A. Carroll-Portillo" 2 => "H.C. Lin" ] ] ] ] ] "host" => array:1 [ 0 => array:2 [ "doi" => "10.3390/microorganisms11071772" "Revista" => array:4 [ "tituloSerie" => "Microoganisms." 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