Objetivo: Utilizar el método de PCR-RFLP para el tipado molecular de los serotipos incluidos en la vacuna PCV-13.
Material y métodos: Se utilizó la base de datos Rebase con 139enzimas de restricción tipoII y 115secuencias de ADN de los genes capsulares obtenidas de GenBank. Se desarrolló un programa informático para la combinación de las dos bases de datos con el objetivo de predecir in silico los fragmentos para cada serotipo utilizando una o más enzimas de restricción.
Resultados: Dos enzimas de restricción (Sse9I, AluI) proporcionaron las mayores diferencias entre los diferentes patrones de bandas de los serotipos en estudio. El PCR-RFLP simulado con Sse9I predijo patrones únicos para los serotipos: 1, 3, 4, 5, 6A, 6B, 14, 19A, 19F y 23F. Algunos serotipos compartían patrones con otros serotipos del mismo serogrupo: 7A/7F, 9A/9V/9F, 18B/18C, que se resolvieron con una segunda enzima de restricción.
Discusión/Conclusiones: El presente estudio ha demostrado que el método PCR-RFLP utilizado con los genes capsulares puede ser una herramienta útil para el tipado molecular de los serotipos incluidos en la vacuna neumocócica PCV-13.
Palabras clave: Vacuna; Neumococo; Endonucleasas