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Vol. 21. Núm. 1.
Páginas 76 (enero - marzo 2017)
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Análisis genético del mestizaje y su relación con el carcinoma gástrico en casos y controles colombianos
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Rodrigo Prieto Sáncheza, John Suarez Olayaa, Ángel Criollo Rayoa, Alix Andrea Guevara Tiquea, Mabel Elena Bohórqueza,
Autor para correspondencia
mebohorquez@ut.edu.co

Autor para correspondencia.
, Gilber Mateusc, Fernando Bolañosd, Alejandro Vélez Hoyose, Paul Lottb, Luis Carvajal Carmonab, Ma. Magdalena Echeverry de Polancoa
a Grupo de investigación Citogenética, Filogenia y Evolución de Poblaciones, Facultades de Ciencias y Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad del Tolima, Ibagué, Colombia
b Genome Center, Department of Biochemistry and Molecular Medicine, School of Medicine-University of California, Davis. GBSF, 451 Health Science Drive Davis, California. 95616-8816. USA
c Departamento de patología Hospital Federico Lleras Acosta Ibagué, Colombia
d Unidad de Patología, Hospital Universitario Hernando Moncaleano Perdomo, Neiva, Colombia
e Laboratorio de patología Hospital Pablo Tobón Uribe, Laboratorio Dinámica, Medellín, Colombia
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Introducción: El cáncer gástrico presenta una variación en las tasas de incidencia y mortalidad entre regiones y grupos étnicos de una misma localidad.

Objetivo: Analizar el componente de ancestría en 124 casos colombianos con cáncer gástrico y 972 controles mediante la tipificación de 33.565 SNP autosómicos del panel UK biobank Axyom, con el fin de establecer las posibles relaciones de estos componentes con el riesgo de la enfermedad.

Materiales: Se obtuvieron 124 muestras de sangre de casos y 972 de controles sanos del consorcio CHIBCHA. La clasificación histológica del tumor se realizó según Lauren: intestinal (CGI), difuso (CGD) y mixto (CGM). Se genotipificaron 33.565 SNP autosómicos. Los componentes ancestrales se calcularon empleando el programa ADMIXTURE. Las medidas de resumen y los modelos multivariados se implementaron en lenguaje de R.

Resultados: Los hombres fueron diagnosticados con mayor frecuencia con CGI (54,7%), y en las mujeres fue CGD (58,3%). Los componentes ancestrales de nativos americanos, europeos y africanos fueron significativamente diferentes al comparar casos (0,46, 0,49 y 0,05) y controles (0,41, 0,52 y 0,07) con p<0,05. Aunque los casos diagnosticados con los diferentes tipos histológicos del tumor presentaron ancestría nativa mayor que los controles (0,45, 0,47 y 0,48) en la regresión logística y multinomial, los coeficientes no fueron significativos.

Conclusiones: La ancestría nativa americana tiende a ser mayor en los casos con controles, y en cada uno de los subtipos de CG; se requiere un mayor tamaño de muestra para establecer el aporte real de dicho componente al riesgo de desarrollar la enfermedad.

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