Cambios en la microbiota intestinal de pacientes críticos con sepsis una semana después del ingreso a la Unidad de Cuidados Intensivos

Resumen

Objetivo

Describir el cambio en la microbiota intestinal de pacientes críticos con sepsis entre el ingreso y una semana después de la estancia en Unidades de Cuidados Intensivos (UCI).

Métodos

Estudio observacional de cohorte prospectiva. Fueron incluidos pacientes críticos con sepsis con muestra de heces al ingreso y siete días después. La microbiota intestinal se evaluó secuenciando el gen 16S rRNA. Se analizó abundancia relativa, alfa y beta diversidad e interacción de la microbiota con variables de interés.

Resultados

La muestra final estuvo conformada por 28 pacientes. Al ingreso y al día siete la microbiota intestinal se caracterizó por filos y géneros patógenos. Siete días después, se observó una disminución significativa en abundancia y riqueza (p < 0.05) y una dispersión significativa de la comunidad microbiana que explicó en un 15,9% su variabilidad (p < 0.05). El modelo lineal mixto mostró asociación significativa estricta de géneros a la mayoría de las variables, y asociados a los dos momentos, disminución significativa al día siete de Peptococcus y Desulfovibrio, géneros patógenos (p < 0.05).

Conclusión

Siete días después del ingreso a la UCI, la microbiota intestinal de los pacientes críticos con sepsis disminuyó en abundancia y diversidad, y aunque se caracterizó por la presencia de patógenos, una semana después mostró una disminución de algunos de estos géneros. Son necesarios estudios que evalúen cambios en el mediano y largo plazo de la microbiota intestinal y estrategias a implementar para su modulación.

Abstract

Objectives

To describe the change in GM of critically ill patients with sepsis between admission and one week after Intensive Care Unit (ICU) stay.

Methods

Prospective observational cohort study. Sample collected from critically ill patients with sepsis with a stool sample on admission and 7 days later. GM was analysed by sequencing of the 16S rRNA gene. Relative abundance, alpha and beta diversity, and interaction of GM with variables were evaluated.

Results

The final sample included 28 patients. On admission on day 7, GM was characterized by pathogenic phyla and genera. Seven days later, a significant decrease in abundance and richness (p < .05) and a significant dispersion of the microbial community structure that explained its variability in 15.9% (p < .05) were observed. The mixed linear model showed a significant strict association of genera with most of the variables, and associated with the two moments, significant decrease on day 7 of Peptococcus and Desulfovibrio, pathogenic genera (p < .05).

Conclusión

Seven days after ICU admission, the GM of critically ill patients with sepsis decreased in abundance and diversity, and although it was characterized by the presence of pathogens, a week later it showed a decrease in some of these genera. Studies are needed to evaluate changes in the medium and long term of the intestinal microbiota in critically ill patients and strategies for their modulation.