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Vol. 51. Núm. 3.
Páginas 247-250 (julio - septiembre 2019)
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Páginas 247-250 (julio - septiembre 2019)
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Epidemiología molecular de aislados de Acinetobacter baumannii resistentes a carbapenems en Argentina
Molecular epidemiology of carbapenem-resistant isolates of Acinetobacter baumannii in Argentina
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Carlos H. Rodrígueza,
Autor para correspondencia
carlos_hernanrodriguez@hotmail.com

Autor para correspondencia.
, Marcela Nastroa, Silvia A. Floresb, Mónica Rodriguezc, Mariela Spinozzid, Geni Brunie, Ana L. Lópezf, Viviana Davidg, Maria S. Aiassah, Isabel A. Marquési, Osvaldo R. Navarroj, Laura Panicciak, Angela Famigliettia, Grupo colaborativo Acinetobacter Argentina
a Laboratorio de Bacteriología, Departamento de Bioquímica Clínica, Hospital de Clínicas José de San Martín, Facultad de Farmacia y Bioquímica, Universidad de Buenos Aires, INFIBIOC, UBA, Buenos Aires, Argentina
b Hospital Eva Perón, San Miguel de Tucumán
c Hospital Independencia, Santiago del Estero
d Clínica Argentina, General Pico La Pampa
e Hospital del Carmen Mendoza
f Centro de Salud pública «Dr. Abraham Lejtman», Catamarca
g Hospital Interzonal San Juan Bautista Catamarca
h Hospital Córdoba, Córdoba
i Hospital «Dr. Julio C. Perrando», Resistencia-Chaco
j Hospital Público Descentralizado «Dr. Guillermo Rawson», San Juan
k Hospital Municipal de Agudos «Dr. Leónidas Lucero», Bahía Blanca, Buenos Aires
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Tabla 1. Distribución de los clones de Acinetobacter baumannii resistentes a los carbapenemes identificados en este estudio
Resumen

Se estudiaron 100 aislados consecutivos y no epidemiológicamente relacionados de Acinetobacter baumannii resistentes a los carbapenems, recuperados entre enero y agosto de 2016 de muestras clínicas en 11 hospitales de 10 provincias de la Argentina, ubicadas en distintas regiones del país. Los genes que codifican las carbapenemasas de Ambler clase D y clase B se investigaron mediante la técnica de PCR utilizando cebadores específicos. Todos los aislados se agruparon mediante las técnicas de 3-locus sequence typing y la secuenciación del gen blaOXA-51-like. El gen blaOXA-23 se recuperó en todos los aislados estudiados. La población de A. baumannii resistente a carbapenems en Argentina estuvo asociada, principalmente, con ST1 (45%), ST25 (34%) y ST79 (15%). ST25 se recuperó en todas las regiones estudiadas y no se detectó CC2.

Palabras clave:
Acinetobacter baumannii
CC1
CC25
Resistencia a carbapenems
Abstract

One hundred sequential, epidemiologically unrelated carbapenem-resistant- Acinetobacter baumannii isolates from 11 hospitals in 10 Argentine provinces were collected between January and August 2016. Genes coding for Ambler class D and B carbapenemases were investigated by PCR using specific primers. All isolates were typed using the 3-locus sequence typing and blaOXA-51-like sequence-based typing techniques. The blaOXA-23 gene was recovered in all isolates studied. The population of carbapenem-resistant- A. baumannii in Argentina was principally associated with ST1 (45%), ST25 (34%) and ST79 (15%). ST25 was recovered in all the regions studied and CC2 was not detected.

Keywords:
Acinetobacter baumannii
CC1
CC25
Carbapenem-resistance
Texto completo

Las infecciones nosocomiales causadas por Acinetobacter baumannii se incrementaron en los últimos años. En forma paralela, aumentó la resistencia a diferentes antimicrobianos, incluidos los carbapenems. A pesar de que la diseminación de los aislados de A. baumannii resistentes a los carbapenems (Ab-RC) es un problema emergente global, los clones y carbapenemasas descritos no son numerosos4,8. En Argentina, la mayoría de los estudios sobre la epidemiología molecular de Ab-RC fueron realizados en la Ciudad Autónoma de Buenos Aires (CABA) y en las provincias de Buenos Aires y Santa Fe12.

El objetivo de este estudio fue determinar la epidemiología molecular y los mecanismos de resistencia a los carbapenems en aislados de Ab-RC recuperados en 10 provincias de nuestro país en el primer semestre de 2016.

Se estudiaron 100 aislados de Ab-RC recuperados de materiales clínicos de pacientes atendidos en 11 centros asistenciales ubicados en diferentes regiones de nuestros país, a saber: CABA (Hospital de Clínicas «José de San Martín»); provincia de Buenos Aires (Hospital Municipal de Agudos Dr. Leónidas Lucero, Bahía Blanca); provincia de Catamarca (Hospital Interzonal San Juan Bautista y Laboratorio Central de Salud pública «Dr. Abraham Lejtman», Catamarca); provincia de Chaco («Dr. Julio C. Perrando», Resistencia); provincia de Córdoba (Hospital Córdoba, Córdoba); provincia de La Pampa (Clínica Argentina-General Pico); provincia de Mendoza (Hospital del Carmen, Mendoza); provincia de San Juan (Hospital Público Descentralizado «Dr. Guillermo Rawson», San Juan); provincia de Santiago del Estero (Hospital Independencia, Santiago del Estero) y provincia de Tucumán (Hospital Eva Perón, Tucumán). Las provincias de Tucumán, Santiago del Estero y Catamarca se agruparon en la región noroeste; Mendoza y San Juan en Cuyo; La Pampa, Córdoba y Buenos Aires en la región Pampeana, mientras que CABA y Chaco en las regiones metropolitana y noreste, respectivamente.

Los aislados se identificaron en el Hospital de Clínicas «José de San Martín» mediante pruebas bioquímicas estándar, la genomoespecie se confirmó mediante el empleo de espectrometría de masas con un equipo MALDI-TOF MS (BrukerDaltonics, Bremen, Alemania) y la detección de blaOXA-511. Se determinaron las concentraciones inhibitorias mínimas de imipenem y meropenem mediante el método de dilución en agar. Las interpretaciones se hicieron de acuerdo con las recomendaciones generales del Clinical and Laboratory Standards Institute2. Los genes que codifican las carbapenemasas de clases B (blaIMP, blaVIM, blaNDM, blaSPM) y D (blaOXA-23, blaOXA-58, blaOXA-40-like, blaOXA-51 y blaOXA-143) de Ambler se investigaron mediante PCR usando cebadores específicos, seguido de secuenciación3,9. Todos los aislados se agruparon mediante la técnica 3-locus sequence typing (3-LST) y la secuenciación de blaOXA-51(SBT)10,13.

Los resultados de SBT o 3-LST se consideraron válidos si los perfiles obtenidos fueron previamente asignados a un complejo clonal (CC) o secuenciotipo (ST) mediante multilocus sequence typing; de lo contrario, se consideraron como indeterminados4,10,13.

Las concentraciones inhibitorias mínimas de imipenem y meropenem fueron en todos los aislados superiores a 4μg/ml. Los genes blaOXA-51 y blaOXA-23 se detectaron en todos los aislados. Por el contrario, blaOXA-143, blaOXA-72 y MBL no fueron detectados. El ST1 fue el secuenciotipo más frecuente; sin embargo, el ST25 fue el único que se encontró en todas las regiones, pero solo fue mayoritario en la región noroeste. El ST79 se detectó fundamentalmente en la región noreste. Seis aislados no pudieron identificarse a nivel de ST (tabla 1).

Tabla 1.

Distribución de los clones de Acinetobacter baumannii resistentes a los carbapenemes identificados en este estudio

  Número de aislamientos
Región  ST1  ST25  ST79  ID* 
Noroeste  14     
Noreste    12   
Cuyo  15   
Pampeana  15     
Metropolitana 
Total nacional (n=%)  (45)  (34)  (15)  (6) 
*

: indeterminados.

De manera coincidente con lo que informan estudios previos tanto nacionales como internacionales, en nuestro trabajo se observó claramente el predominio de la carbapenemasa OXA-23. También se confirmó, ahora a nivel nacional, el total desplazamiento de OXA-58, previamente observada en la región metropolitana12. A diferencia de lo publicado en varios países de Sudamérica (Ecuador, Colombia y Brasil), no se determinó la presencia de OXA-72. En los mencionados países, dicha carbapenemasa no solo es detectada en forma esporádica, sino también en brotes epidémicos6,11,14. Tampoco se determinó la presencia de OXA-143, la cual es endémica en algunos centros asistenciales del sur de Brasil5,14. A diferencia de otros reportes nacionales, en A. baumannii y en otras genomoespecies, no encontramos ningún aislado productor de NDM7.

En estudios previos realizados en Argentina y en otros países de la región, se determinó un predominio de los clones CC113/CC79, CC104/CC15 y CC109/CC1 y un aumento de CC110/ST25 en los últimos años6,11,12,14. En este trabajo observamos que los ST1 (CC109/CC1), ST25 (CC110/ST25) y ST79 (CC113/CC79) representaron el 94% de los aislados. Si bien el ST1 se recuperó en mayor proporción (45%), solo el ST25 se aisló en las cinco regiones que comprendió este estudio, dato coincidente con la diseminación observada en algunos países de la región11. Cabe destacar que el ST79, con importante presencia en estudios anteriores, solo se recuperó en la región metropolitana y la del noreste12 (tabla 1).

En este estudio, se puede observar que a pesar de las amplias distancias que separan a las regiones estudiadas, no hay grandes diferencias en la epidemiología molecular (carbapenemasas y clones predominantes) en la población de A. baumannii resistente a los carbapenems.

Financiación

Este trabajo ha sido realizado con el subsidio de la Secretaría de Ciencia y Técnica de la Universidad de Buenos Aires (UBACyT 20020130100167BA) de Ángela Famiglietti.

Conflicto de intereses

Los autores declaran no tener ningún conflicto de intereses.

Anexo

Grupo Acinetobacter: Carlos Vaya, Beatriz Yolanda Pondalb, Carlos Fabián Bilavcikb, Mónica Graciela Duradalb, Enrique Gabriel Oliverac, Nadya Bastiase, Cecilia Pandolfoe, Alicia Garuttih, Jimena Minolih, Susana Mosconih, Mariana Carol Reyi, Eleonora María del Valle Bavastro j, Marisa Myriam Lópezj, Patricia Raneaj, Cintia Verónica Amalricj, Alicia Carricak, Dina Pedersenk, Celeste Martínezk.

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En el anexo se incluyen los miembros del Grupo colaborativo Acinetobacter Argentina.

Copyright © 2018. Asociación Argentina de Microbiología
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